27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7151 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  477  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  56.96 
 
 
234 aa  264  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  43.41 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  44.72 
 
 
213 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  40 
 
 
240 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  41.86 
 
 
222 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4978  hypothetical protein  39.2 
 
 
215 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  36.82 
 
 
214 aa  134  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  37.5 
 
 
233 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  37.57 
 
 
208 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  39 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  38.73 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  35.05 
 
 
221 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  36.22 
 
 
208 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  35.61 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  37.56 
 
 
241 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09311  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125843  normal  0.822415 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48406  predicted protein  30.41 
 
 
369 aa  82  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  31.05 
 
 
442 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09208  conserved hypothetical protein  32.23 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  28.04 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  27.03 
 
 
240 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  26.77 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43516  predicted protein  29.6 
 
 
360 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.019532  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  28.64 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  24.88 
 
 
524 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  29.38 
 
 
476 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>