18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33199 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  100 
 
 
257 aa  532  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48406  predicted protein  25.1 
 
 
369 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  28.96 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  29.44 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  26.23 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  26.09 
 
 
234 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  26.18 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  22.95 
 
 
240 aa  52.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43516  predicted protein  25.58 
 
 
360 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.019532  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  28.64 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09208  conserved hypothetical protein  23.98 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  26.13 
 
 
219 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  25 
 
 
208 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  27.59 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  23.92 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  21.78 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  21.92 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  22.42 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>