29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3844 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  542  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  58.52 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  58.52 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  62.2 
 
 		 272 aa  318  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  58.15 
 
 		 323 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  61.26 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  61.79 
 
 		 272 aa  314  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  63.27 
 
 		 221 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  63.05 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  57.14 
 
 		 305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  58.56 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  59.52 
 
 		 277 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  59.51 
 
 		 236 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  59.24 
 
 		 229 aa  284  9e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  57.33 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  52.56 
 
 		 213 aa  251  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  51.23 
 
 		 231 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  37.67 
 
 		 211 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  34.4 
 
 		 216 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  25.39 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25.27 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  25.39 
 
 		 476 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  25.76 
 
 		 524 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  23.63 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  21.88 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  25.45 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 442 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  22.49 
 
 		 211 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>