25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0273 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  54.91 
 
 		 221 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  54.05 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  53.71 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  54.05 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  51.23 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  53.6 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  50.21 
 
 		 255 aa  218  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  51.57 
 
 		 277 aa  214  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  49.11 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  43.93 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  47.53 
 
 		 213 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  42.22 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  48.48 
 
 		 229 aa  198  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  42.59 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  42.96 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  42.22 
 
 		 323 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  37.96 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  36.71 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  28.5 
 
 		 476 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  26.98 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  25.64 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  24.75 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  24.52 
 
 		 524 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  24.04 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>