25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1501 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  39.2 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  37.69 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  35.02 
 
 		 236 aa  144  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  38.35 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  41.12 
 
 		 213 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  36.27 
 
 		 272 aa  141  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  33.66 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  34.91 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  34.4 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  34.2 
 
 		 272 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  34.72 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  36.71 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  35.05 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  36.32 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  32.38 
 
 		 323 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  32.1 
 
 		 305 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  32.1 
 
 		 272 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  31.97 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  27.51 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  27.37 
 
 		 476 aa  52  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  24.44 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25.28 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  26 
 
 		 442 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  27.44 
 
 		 215 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>