More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06221 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06221  aminotransferases class-I  100 
 
 
398 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1774  aminotransferase  58.46 
 
 
396 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0590  aminotransferase  59.23 
 
 
396 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  41.98 
 
 
388 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  42.6 
 
 
392 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  42.49 
 
 
392 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  42.64 
 
 
390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  45.24 
 
 
392 aa  316  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  41.79 
 
 
400 aa  315  7e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  41.08 
 
 
407 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  43 
 
 
390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  41.73 
 
 
388 aa  265  8e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  37.06 
 
 
391 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  38.94 
 
 
388 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  36.07 
 
 
392 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.29 
 
 
388 aa  256  7e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  32.9 
 
 
384 aa  255  9e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  34.45 
 
 
382 aa  253  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 
382 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  34.02 
 
 
390 aa  252  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  34.63 
 
 
403 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  39.6 
 
 
387 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  34.19 
 
 
382 aa  249  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.08 
 
 
392 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  33.93 
 
 
402 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  33.93 
 
 
392 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.62 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.5 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.26 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.82 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  33.84 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  33.33 
 
 
400 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  34.88 
 
 
394 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.89 
 
 
385 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  34.22 
 
 
389 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  38.11 
 
 
391 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  34.63 
 
 
394 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  33.76 
 
 
382 aa  238  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.3 
 
 
388 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  33.84 
 
 
403 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  29.34 
 
 
389 aa  234  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  33.52 
 
 
393 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  30.87 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  34.01 
 
 
428 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  32.21 
 
 
399 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  32.14 
 
 
414 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3182  aminotransferase class I and II  38.46 
 
 
384 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.67 
 
 
390 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  31.81 
 
 
412 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  32.91 
 
 
388 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  31.63 
 
 
412 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  31.63 
 
 
412 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  31.63 
 
 
412 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  31.63 
 
 
412 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  31.63 
 
 
412 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  30.97 
 
 
391 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  31.65 
 
 
400 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  32.74 
 
 
402 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  31.65 
 
 
399 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  32.58 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  32.58 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2505  aminotransferase  32.87 
 
 
407 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784571  normal  0.124527 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  31.55 
 
 
412 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  31.55 
 
 
412 aa  226  7e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  31.55 
 
 
412 aa  226  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  31.55 
 
 
412 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  31.55 
 
 
412 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  32.32 
 
 
402 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  32.74 
 
 
402 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  32.99 
 
 
402 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  32.57 
 
 
418 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  31.55 
 
 
412 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  32.32 
 
 
412 aa  225  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  31.81 
 
 
411 aa  225  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  32.32 
 
 
402 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  31.55 
 
 
412 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  31.93 
 
 
399 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  30.56 
 
 
394 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  30.15 
 
 
386 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  31.37 
 
 
399 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  32.06 
 
 
405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  31.28 
 
 
399 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  31.37 
 
 
400 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  31.28 
 
 
399 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  33.15 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  31.3 
 
 
397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.44 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  31.09 
 
 
400 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  31.09 
 
 
399 aa  220  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  32.71 
 
 
409 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  31.3 
 
 
396 aa  220  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  32.37 
 
 
390 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  31.02 
 
 
393 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  31.3 
 
 
397 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.07 
 
 
392 aa  219  6e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  33.8 
 
 
395 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  30.28 
 
 
397 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  34.08 
 
 
394 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 
399 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>