More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1774 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1774  aminotransferase  100 
 
 		 396 aa  800    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0590  aminotransferase  73.74 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06221  aminotransferases class-I  58.46 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  42.47 
 
 		 400 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  43.83 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  41.62 
 
 		 388 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  41.46 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  43 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  40.95 
 
 		 392 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  41.62 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  39.37 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  36.22 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  41.78 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.79 
 
 		 388 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.08 
 
 		 385 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.22 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  37.5 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  34.61 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.11 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  36.06 
 
 		 392 aa  249  9e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.93 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  34.05 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  34.78 
 
 		 402 aa  244  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.05 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.74 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  32.98 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.4 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  31.63 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  31.38 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  34.66 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  32.99 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  31.63 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  33.25 
 
 		 384 aa  240  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  34.66 
 
 		 405 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  31.63 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  33.95 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  33.76 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  32.99 
 
 		 382 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  32.36 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  32.36 
 
 		 399 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.54 
 
 		 387 aa  239  9e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  33.24 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  34.38 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  39.24 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  34.38 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  31.83 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  35.29 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  34.38 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  36.21 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  31.12 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  34.54 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  31.83 
 
 		 399 aa  235  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  34.38 
 
 		 412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0217  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  34.02 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  33.25 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  30.87 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  30.61 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  34.66 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  35.01 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  33.6 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  33.33 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  34.78 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  33.33 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 394 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.59 
 
 		 388 aa  232  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.59 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  34.72 
 
 		 389 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  33.42 
 
 		 382 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  33.33 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  33.33 
 
 		 411 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  33.52 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.68 
 
 		 390 aa  229  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  32.78 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  33.52 
 
 		 409 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  33.52 
 
 		 402 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  32.46 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  32.78 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  30.51 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  30.86 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  32.95 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  32.95 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  32.95 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  32.1 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  32.1 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0218  aspartate aminotransferase  28.32 
 
 		 401 aa  223  7e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3182  aminotransferase class I and II  39.06 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  32.23 
 
 		 411 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>