More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01401 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
365 aa  752    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0061  CDP-glucose 4,6-dehydratase  56.25 
 
 
368 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0769235  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  54.11 
 
 
386 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3334  CDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 
386 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 
357 aa  341  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4735  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
363 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  0.159125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3658  CDP-glucose 4,6-dehydratase  50.14 
 
 
363 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.758357  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07611  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.82 
 
 
360 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0332  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.81 
 
 
364 aa  333  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106161  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.17 
 
 
372 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3349  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.45 
 
 
358 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2291  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.91 
 
 
361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3050  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.51 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3190  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.81 
 
 
357 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170575  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4602  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.89 
 
 
359 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0921242  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12911  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.16 
 
 
366 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.253167  hitchhiker  0.00798919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0709  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.79 
 
 
356 aa  323  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3718  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.32 
 
 
360 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316077  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1480  CDP-glucose 4,6-dehydratase  49.14 
 
 
353 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0627  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.09 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0774  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.94 
 
 
362 aa  319  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1603  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.23 
 
 
371 aa  318  6e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2324  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.1 
 
 
359 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2431  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.1 
 
 
359 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.310419  hitchhiker  0.0000678484 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2216  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.1 
 
 
359 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.776521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2273  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.1 
 
 
359 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27770  CDP-glucose 4,6-dehydratase  51.14 
 
 
358 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2191  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.71 
 
 
365 aa  317  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00831743  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2317  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.82 
 
 
359 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0156634 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1880  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.21 
 
 
358 aa  315  9e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.17 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0856  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.72 
 
 
367 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.92 
 
 
358 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.33 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1424  hypothetical protein  43.58 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0353322  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3789  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.13 
 
 
361 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3529  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.53 
 
 
362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0592  CDP-glucose 4,6-dehydratase  49.29 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1702  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.25 
 
 
362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.412551  hitchhiker  0.000000000000117345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3062  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.18 
 
 
352 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2715  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.09 
 
 
366 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.525402  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0663  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
361 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0569  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
361 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1962  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
357 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.09 
 
 
366 aa  296  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000773514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1960  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.73 
 
 
362 aa  296  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1983  CDP-glucose 4,6-dehydratase (O-antigen-related)  46.61 
 
 
357 aa  294  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0771  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.51 
 
 
372 aa  292  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0223168 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0130  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.64 
 
 
353 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.837916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4419  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.77 
 
 
361 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0876  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.75 
 
 
371 aa  286  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1257  NAD-dependent epimerase/dehydratase:polysaccharide biosynthesis protein CapD  44.94 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0777  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.69 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3374  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.46 
 
 
351 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1131  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.5 
 
 
367 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
367 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2876  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.72 
 
 
355 aa  279  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0806  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.66 
 
 
364 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0841534  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1258  CDP-glucose 4,6-dehydratase  49 
 
 
364 aa  279  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3695  CDP-glucose-4,6-dehydratase, putative  44.48 
 
 
368 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3070  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.62 
 
 
351 aa  275  8e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3396  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.34 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3400  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.34 
 
 
351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2888  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.97 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4510  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.6 
 
 
354 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0847  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.38 
 
 
368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307113  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1909  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.09 
 
 
369 aa  270  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.8 
 
 
357 aa  269  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4218  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.19 
 
 
354 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.527744  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3352  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.62 
 
 
362 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0387  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.94 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10410  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.34 
 
 
395 aa  242  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2561  CDP-glucose 4,6-dehydratase  37.18 
 
 
379 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1872  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.44 
 
 
357 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.759181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
331 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
324 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.33 
 
 
336 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.87 
 
 
336 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
413 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
328 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
411 aa  96.7  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000639635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.13 
 
 
336 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1850  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.91 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0128954  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.54 
 
 
343 aa  90.1  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.51 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.7 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.215848 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
329 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.81 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.23 
 
 
334 aa  87.4  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1704  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.97 
 
 
340 aa  87  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00817913  normal  0.680282 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.87 
 
 
378 aa  86.3  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5396  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.22 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.38 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0209  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.43 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.75 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  22.09 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>