More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3334 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  97.41 
 
 
386 aa  757    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.824232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3334  CDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 
386 aa  803    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0061  CDP-glucose 4,6-dehydratase  55.91 
 
 
368 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0769235  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  53.85 
 
 
365 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2431  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.5 
 
 
359 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.310419  hitchhiker  0.0000678484 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2324  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.5 
 
 
359 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0783  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.84 
 
 
357 aa  345  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2216  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.5 
 
 
359 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.776521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2273  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.5 
 
 
359 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000124958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.03 
 
 
357 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07611  CDP-glucose 4,6-dehydratase  49.11 
 
 
360 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1603  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.66 
 
 
371 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2317  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.22 
 
 
359 aa  342  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0156634 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0332  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.09 
 
 
364 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106161  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3050  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.97 
 
 
391 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12911  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.1 
 
 
366 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.253167  hitchhiker  0.00798919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3190  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.97 
 
 
357 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170575  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2191  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.85 
 
 
365 aa  338  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00831743  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0856  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.55 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.69 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1880  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.58 
 
 
358 aa  336  5e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.457819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3349  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.36 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3789  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.43 
 
 
361 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4735  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.09 
 
 
363 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  0.159125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3658  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.09 
 
 
363 aa  332  8e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.758357  normal  0.169877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0774  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.53 
 
 
362 aa  332  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1424  hypothetical protein  47.24 
 
 
361 aa  332  9e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0353322  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0709  CDP-glucose 4,6-dehydratase  48.82 
 
 
356 aa  331  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3062  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.5 
 
 
352 aa  331  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2291  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.01 
 
 
361 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0876  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.25 
 
 
371 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4602  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.79 
 
 
359 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0921242  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0663  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.6 
 
 
361 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0569  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.6 
 
 
361 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1962  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.6 
 
 
357 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.63 
 
 
366 aa  319  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.61 
 
 
367 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295037  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2888  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.26 
 
 
368 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1983  CDP-glucose 4,6-dehydratase (O-antigen-related)  45.21 
 
 
357 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.57 
 
 
358 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1909  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45 
 
 
369 aa  315  9e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3529  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.22 
 
 
362 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1960  CDP-glucose 4,6-dehydratase  47.73 
 
 
362 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1702  CDP-glucose 4,6-dehydratase  46.94 
 
 
362 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.412551  hitchhiker  0.000000000000117345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27770  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.3 
 
 
358 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1257  NAD-dependent epimerase/dehydratase:polysaccharide biosynthesis protein CapD  45.98 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1131  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.15 
 
 
367 aa  307  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3401  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.78 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000773514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3695  CDP-glucose-4,6-dehydratase, putative  45.98 
 
 
368 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0592  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.85 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3374  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.02 
 
 
351 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.2 
 
 
360 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0627  CDP-glucose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 
366 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1480  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.51 
 
 
353 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.26 
 
 
357 aa  298  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3070  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.48 
 
 
351 aa  296  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0771  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.11 
 
 
372 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0223168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2876  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.61 
 
 
355 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3718  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.16 
 
 
360 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.316077  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1258  CDP-glucose 4,6-dehydratase  45.5 
 
 
364 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0130  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.55 
 
 
353 aa  293  5e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.837916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3396  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.66 
 
 
351 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3400  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.7 
 
 
351 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0777  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.78 
 
 
358 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4218  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.01 
 
 
354 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.527744  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0806  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.38 
 
 
364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0841534  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4510  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.29 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0220164  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0847  CDP-glucose 4,6-dehydratase  42.11 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307113  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2715  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.76 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.525402  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2561  CDP-glucose 4,6-dehydratase  39.88 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3352  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.55 
 
 
362 aa  268  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0387  CDP-glucose 4,6-dehydratase  43.41 
 
 
367 aa  268  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4419  CDP-glucose 4,6-dehydratase  41.55 
 
 
361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10410  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.12 
 
 
395 aa  249  5e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1872  CDP-glucose 4,6-dehydratase  40.41 
 
 
357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.986998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2838  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
331 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
406 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
331 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.759181  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
413 aa  104  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.245536  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
411 aa  102  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000639635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
329 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3017  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.91 
 
 
340 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0758664 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 
417 aa  92.8  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0350628  normal  0.478432 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.96 
 
 
330 aa  92.8  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0107  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.37 
 
 
367 aa  89.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1064  hypothetical protein  26.12 
 
 
337 aa  88.6  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.732456 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.5 
 
 
336 aa  88.6  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0896944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.92 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.78 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.14 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1117  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.4 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.62 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.1 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.95 
 
 
336 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.92 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.65 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.8 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>