191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2671 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  100 
 
 
277 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  57.3 
 
 
278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.96 
 
 
278 aa  297  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.15 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  54.38 
 
 
291 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  52.02 
 
 
280 aa  231  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.09 
 
 
281 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.74 
 
 
288 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.66 
 
 
299 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.93 
 
 
290 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.75 
 
 
299 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.52 
 
 
293 aa  188  7e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.94 
 
 
294 aa  182  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  32 
 
 
394 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  34.47 
 
 
394 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  34.95 
 
 
394 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  31.54 
 
 
393 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.95 
 
 
394 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  28.03 
 
 
400 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  33.5 
 
 
394 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  31.45 
 
 
388 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  29.86 
 
 
378 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  30.51 
 
 
405 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  30.31 
 
 
378 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  35.44 
 
 
395 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  30.63 
 
 
400 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  35.87 
 
 
413 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  31.37 
 
 
400 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  35.87 
 
 
405 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  29.89 
 
 
389 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  28.23 
 
 
392 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  31.15 
 
 
383 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  28 
 
 
392 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  30.83 
 
 
397 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  34.39 
 
 
399 aa  92  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.96 
 
 
395 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  30.55 
 
 
392 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  30.55 
 
 
392 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  34.95 
 
 
242 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  31.45 
 
 
399 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  34.24 
 
 
228 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  33.2 
 
 
414 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  29.17 
 
 
390 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  31.48 
 
 
394 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.15 
 
 
386 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  29.9 
 
 
393 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  29.52 
 
 
386 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  27.82 
 
 
380 aa  85.5  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  27.82 
 
 
380 aa  85.5  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  28.52 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  30.91 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  29.02 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10612  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02370)  29.3 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.273012 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0868  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  26.6 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4893  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  25.76 
 
 
290 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2370  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  26.32 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.919001  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3270  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  25.76 
 
 
290 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0782  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  27.66 
 
 
245 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6914  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  25.35 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  27.4 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0404  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  24.28 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11849  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0204  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  29.38 
 
 
293 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328291  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30014  degradation of aromatic compounds  27.88 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.437797 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0089  FAH family protein  29.93 
 
 
271 aa  53.1  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675246 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09031  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01490)  32.48 
 
 
295 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4678  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  25.94 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.451355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1468  2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase  26.84 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000234115  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1084  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  27.42 
 
 
254 aa  52.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000583764  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2333  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  24.89 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000186232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2256  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  29.01 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2752  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  26.5 
 
 
276 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3438  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  27.62 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3036  fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2  31.48 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1890  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.5 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1503  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  26.11 
 
 
302 aa  52  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000155148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1390  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  25.58 
 
 
301 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.367054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2313  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  28.48 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0853  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  25.42 
 
 
289 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3932  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.05 
 
 
329 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.707653  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1940  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  27.51 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1581  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.68 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0535  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  25.71 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.339338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4430  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  22.73 
 
 
290 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19045  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3934  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  27.67 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916844  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3608  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  27.92 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2289  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  27.37 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3892  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  25.64 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.192385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0886  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  27.38 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  28.8 
 
 
637 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0968  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  29.25 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0987  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  29.25 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141309  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5929  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  27.57 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2938  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.8 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4305  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  28.48 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2383  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  31.38 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.203143  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0305  5-oxopent-3-ene-1,2, 5-tricarboxylatedecarboxylase  30.5 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.966001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0556  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  28.67 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0160  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  26.11 
 
 
288 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0938  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  28.02 
 
 
235 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6065  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  23.81 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>