53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0733 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  787    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  70.33 
 
 		 395 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  60.15 
 
 		 390 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  60.87 
 
 		 393 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  58.46 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  59.8 
 
 		 394 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  60.21 
 
 		 399 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  60.94 
 
 		 386 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.58 
 
 		 388 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  60.51 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  59.03 
 
 		 391 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  59.14 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  58.87 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  58.87 
 
 		 413 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  59.11 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  58.95 
 
 		 386 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  59.68 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  58.12 
 
 		 397 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  57.33 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  57.91 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  57.58 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  57.65 
 
 		 389 aa  431  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  58.38 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.38 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  56.92 
 
 		 378 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  59.18 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  58.67 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  58.31 
 
 		 395 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  58.67 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  58.22 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  58.46 
 
 		 383 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  56.35 
 
 		 378 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  53.12 
 
 		 380 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  52.86 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  53.12 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  56.4 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  52.19 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  67.53 
 
 		 242 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  64.55 
 
 		 228 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.07 
 
 		 290 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.18 
 
 		 291 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  28.23 
 
 		 277 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.22 
 
 		 299 aa  92.8  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.96 
 
 		 272 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.8 
 
 		 278 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.26 
 
 		 281 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.8 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.6 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.65 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.03 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  25.83 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  26.69 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  29.79 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.886645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>