66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4300 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  71 
 
 		 395 aa  335  3.9999999999999995e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  68.26 
 
 		 394 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  67.53 
 
 		 392 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  67.39 
 
 		 394 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  67.39 
 
 		 394 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  66.52 
 
 		 395 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  66.52 
 
 		 394 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  67.24 
 
 		 394 aa  323  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  66.09 
 
 		 386 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  66.09 
 
 		 386 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  68.42 
 
 		 392 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  68.42 
 
 		 392 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  64.14 
 
 		 413 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  64.14 
 
 		 405 aa  315  6e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  67.54 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  66.67 
 
 		 390 aa  314  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  63.18 
 
 		 405 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  66.09 
 
 		 378 aa  311  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  66.52 
 
 		 388 aa  309  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  65.8 
 
 		 394 aa  307  8e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  66.09 
 
 		 391 aa  306  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  64.5 
 
 		 393 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  63.88 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  66.23 
 
 		 399 aa  305  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  66.23 
 
 		 397 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  66.23 
 
 		 399 aa  303  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  58.9 
 
 		 400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  63.2 
 
 		 392 aa  300  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  62.55 
 
 		 400 aa  295  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  63.2 
 
 		 389 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  63.04 
 
 		 383 aa  290  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  61.3 
 
 		 378 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  60.43 
 
 		 380 aa  281  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  60.43 
 
 		 380 aa  281  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  60.43 
 
 		 380 aa  280  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  58.95 
 
 		 414 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  60.35 
 
 		 400 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  61.54 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.17 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.27 
 
 		 272 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.29 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.1 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.5 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.47 
 
 		 290 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.16 
 
 		 299 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  34.95 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.87 
 
 		 280 aa  88.6  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.41 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.28 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.45 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.87 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  28.78 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  32.84 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0089  FAH family protein  27.86 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9074  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1 7-dioic acid hydratase (catechol pathway)-like protein  33.33 
 
 		 637 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0886  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  27.27 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1581  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.86 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0204  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  27.92 
 
 		 293 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2925  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  28.28 
 
 		 260 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1084  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  25.76 
 
 		 254 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000583764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1474  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  24.62 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0595043  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.07 
 
 		 277 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0140725  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3538  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  26.53 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.253833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1144  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  31.08 
 
 		 202 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  28.89 
 
 		 644 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>