55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2483 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  791    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  71.02 
 
 		 389 aa  568  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  59.02 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  57.58 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  61.02 
 
 		 405 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  60.64 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  59.18 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  56.81 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  60.75 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  57.73 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  59.84 
 
 		 378 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  59.74 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  57.56 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  56.49 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  57.03 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  58.62 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  55.01 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  56.04 
 
 		 396 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  56.95 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  54.97 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  57.14 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  54.73 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  54.73 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  57.07 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.4 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  56.4 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  54.73 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  55.64 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  56.54 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  54.22 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  53.75 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  54.12 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  53.87 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  53.87 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  53.97 
 
 		 383 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  49.48 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  52.53 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  67.73 
 
 		 228 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  63.2 
 
 		 242 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.35 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.95 
 
 		 278 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.22 
 
 		 281 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  29.9 
 
 		 288 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  28 
 
 		 277 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.68 
 
 		 278 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.57 
 
 		 299 aa  90.1  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.65 
 
 		 290 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.8 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.51 
 
 		 272 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.22 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.53 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.72 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  29.38 
 
 		 308 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1084  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  26.4 
 
 		 254 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000583764  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1581  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.01 
 
 		 273 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>