54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1358 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  81.44 
 
 		 396 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  80.92 
 
 		 392 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  80.92 
 
 		 392 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  80.66 
 
 		 393 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  78.17 
 
 		 394 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  77.44 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  76.15 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  77.44 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  77.44 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.7 
 
 		 386 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  60.99 
 
 		 388 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  59.54 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  60.64 
 
 		 386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  61.21 
 
 		 378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  60.71 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  57.53 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  60.78 
 
 		 391 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  58.82 
 
 		 392 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  60.64 
 
 		 378 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  58.66 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  55.32 
 
 		 400 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  57.73 
 
 		 380 aa  425  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  59.26 
 
 		 405 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  57.73 
 
 		 380 aa  425  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  58.99 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  57.99 
 
 		 380 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  58.99 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  56.4 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  55.13 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  56.85 
 
 		 395 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  56.15 
 
 		 383 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  56.03 
 
 		 397 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  54.22 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  53.57 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  51.65 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  52.49 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  66.52 
 
 		 242 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  70.59 
 
 		 228 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.1 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.8 
 
 		 291 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.51 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  35.44 
 
 		 277 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.29 
 
 		 272 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.15 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.68 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.16 
 
 		 290 aa  89.7  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.87 
 
 		 278 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  34.13 
 
 		 280 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.02 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.41 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.84 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2107  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  27.59 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2542  hypothetical protein  26.87 
 
 		 308 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.548938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>