281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2311 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2311  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  634    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1155  PfkB domain protein  32.25 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  28.52 
 
 		 304 aa  89  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  30.98 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.04 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  29.04 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.55 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28.78 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1077  PfkB domain protein  29.15 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.679287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  30.12 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  28.94 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  27.63 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  28.09 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.49 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  25.93 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  27.38 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  27.38 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.7 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  28.34 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  29.47 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  28.21 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  41.38 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  41.38 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  41.38 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  26.95 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  41.38 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  41.38 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  27.34 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  24.36 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.42 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  30.06 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  25.24 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  23.7 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  27.39 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  27.69 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  40.62 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  24.82 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  28.38 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  30 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  27.31 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  27.31 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  27.69 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  27.16 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  27.31 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  27.31 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  47.14 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  33.53 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  33.53 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.42 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  29.97 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  25.84 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  33.53 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  26.98 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  27.11 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  44.93 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1042  PfkB  28.21 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0569  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  30.77 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  28.98 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  26.98 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  27.99 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.44 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  24 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  37.93 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  41.1 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  27.53 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  25.45 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  48.28 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  28.03 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  24.41 
 
 		 338 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  26.28 
 
 		 308 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  45.9 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  34.65 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  26.73 
 
 		 317 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  35.92 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  28.64 
 
 		 284 aa  52.8  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  30.51 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  24.67 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  24.13 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  27.43 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  34.67 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  24.71 
 
 		 338 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  31.31 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  25.25 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  26.36 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  28.79 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  28.79 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  28.79 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  28.79 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>