35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1155 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1155  PfkB domain protein  100 
 
 
300 aa  621  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2311  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
313 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.216314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  28.99 
 
 
338 aa  52.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  22.44 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  25.18 
 
 
306 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  40.26 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  19.85 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2109  PfkB  33.78 
 
 
282 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  28.16 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  28.89 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  35.29 
 
 
314 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  31.07 
 
 
299 aa  45.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0911  PfkB domain protein  33.33 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0140  PfkB domain protein  25.6 
 
 
326 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  27.78 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  29.9 
 
 
628 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  27.91 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0885  PfkB domain protein  32.05 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  27.62 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.55 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.23 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.9 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.57 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  28 
 
 
324 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.23 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  26.56 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  29.9 
 
 
628 aa  43.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  35.16 
 
 
314 aa  42.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  25.16 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  22.69 
 
 
312 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  30.21 
 
 
316 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  26.87 
 
 
315 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  27.78 
 
 
338 aa  42.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  42.86 
 
 
340 aa  42.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>