More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2096 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2096  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 344 aa  700    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  40.75 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.66 
 
 		 383 aa  205  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  50.46 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  52.42 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  38.12 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  39.67 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1972  HhH-GPD family protein  37.04 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.224545  hitchhiker  0.000205487 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.82 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 364 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  40.38 
 
 		 365 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  47.75 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  41.73 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  41.73 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  40 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.66 
 
 		 355 aa  193  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000489397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  39.23 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  40.94 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  45.24 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  42.11 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  46.15 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  44.09 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.09 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  43.18 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  44.27 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208141 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  47.64 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  47.64 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  44.31 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3375  A/G-specific adenine glycosylase  37.92 
 
 		 404 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.421743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  43.78 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  42.97 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  39.54 
 
 		 373 aa  186  7e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  43.09 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  43.25 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  44.31 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  45.33 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1070  A/G-specific adenine glycosylase  44.53 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  46.64 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  45.83 
 
 		 407 aa  182  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  37.89 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  37.89 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  37.63 
 
 		 399 aa  182  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4978  A/G-specific adenine glycosylase  44.91 
 
 		 349 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.51 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1172  A/G-specific adenine glycosylase  43 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.491873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  46.43 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  46.43 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  46.43 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  37.89 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  46.43 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  46.43 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  46.43 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67990  A/G-specific adenine glycosylase  44.04 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259301  normal  0.0147952 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  46.43 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  44.25 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.59 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1199  A/G-specific adenine glycosylase  38.87 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  42.91 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  44.09 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  41.87 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  44.25 
 
 		 355 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.16 
 
 		 351 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  40.57 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.8 
 
 		 360 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3504  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.578262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3180  A/G-specific adenine glycosylase  40.19 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.91893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.83 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0019  A/G-specific adenine glycosylase  46.43 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0064  A/G-specific adenine glycosylase  44.09 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1299  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.77 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.360149  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.16 
 
 		 375 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  38.44 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  36.39 
 
 		 388 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  36.21 
 
 		 434 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  43.52 
 
 		 388 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  36.75 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  45.58 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  42.34 
 
 		 354 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7652  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 		 405 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448296  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  37.99 
 
 		 371 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  43.25 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0718  A/G-specific adenine glycosylase  43.32 
 
 		 464 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.912653  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.56 
 
 		 384 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0493  A/G-specific adenine glycosylase  36.76 
 
 		 358 aa  172  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.47 
 
 		 363 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  43.88 
 
 		 400 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  36.84 
 
 		 369 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  35.57 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0497  A/G-specific adenine glycosylase  36.76 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248511  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  41.41 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0980  A/G-specific adenine glycosylase  45.81 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>