More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0147 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0147  ribokinase family sugar kinase  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  50.72 
 
 		 308 aa  208  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  51.2 
 
 		 307 aa  207  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  48.08 
 
 		 340 aa  201  8e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  48.54 
 
 		 307 aa  194  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  48.02 
 
 		 304 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  48.02 
 
 		 304 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  44.23 
 
 		 313 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  46.23 
 
 		 307 aa  178  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  46.34 
 
 		 303 aa  174  6e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  41.35 
 
 		 310 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  39.9 
 
 		 310 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  40.19 
 
 		 304 aa  141  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  38.73 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  37.44 
 
 		 307 aa  131  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  37.75 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  35.75 
 
 		 310 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  39.71 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6387  ribokinase  33.66 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.906333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  38.12 
 
 		 303 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  40 
 
 		 302 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  35.61 
 
 		 306 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  38.28 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  34.6 
 
 		 308 aa  121  6e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  38.19 
 
 		 307 aa  121  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  36.32 
 
 		 305 aa  121  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7361  ribokinase  34.31 
 
 		 308 aa  121  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39 
 
 		 299 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  35.92 
 
 		 314 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  38.69 
 
 		 305 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  35 
 
 		 301 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  37.69 
 
 		 305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  36.41 
 
 		 308 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  35.92 
 
 		 305 aa  118  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  37.93 
 
 		 295 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  35.47 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  36.87 
 
 		 299 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  34.95 
 
 		 309 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4655  ribokinase  33.5 
 
 		 319 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.557505 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  34.95 
 
 		 309 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  34.95 
 
 		 309 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  34.95 
 
 		 309 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  34.95 
 
 		 309 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  34.95 
 
 		 309 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  34.95 
 
 		 314 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  34.95 
 
 		 314 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  34.95 
 
 		 309 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  36.27 
 
 		 309 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  36.27 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  36.27 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  36.27 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  36.27 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  35.96 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  37.88 
 
 		 304 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  35.1 
 
 		 319 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  38 
 
 		 309 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  37.7 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  35.03 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  37.2 
 
 		 309 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  35.15 
 
 		 305 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  35.18 
 
 		 303 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  35.18 
 
 		 303 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  33.82 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  34.48 
 
 		 302 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  33.82 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  33.82 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  34.48 
 
 		 318 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  32.67 
 
 		 315 aa  111  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  37 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  37 
 
 		 308 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  34.67 
 
 		 303 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  34.67 
 
 		 303 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  36.1 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  33.83 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1401  ribokinase  32.84 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033164  normal  0.166986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  33.67 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  36.23 
 
 		 309 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  35 
 
 		 303 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  32.18 
 
 		 306 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  37.04 
 
 		 307 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  35.61 
 
 		 302 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  32.18 
 
 		 306 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  32.18 
 
 		 306 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  32.18 
 
 		 306 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  34.48 
 
 		 302 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  32.18 
 
 		 306 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  32.18 
 
 		 306 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  34.69 
 
 		 305 aa  108  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  36.63 
 
 		 308 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  35.15 
 
 		 302 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  34.67 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  34.67 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  35.86 
 
 		 302 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  35.68 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  36.41 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.34 
 
 		 290 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2205  PfkB  33.82 
 
 		 327 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.503057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  38.29 
 
 		 308 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  33.49 
 
 		 297 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  38.83 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>