28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0613 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0613  integrase family protein  100 
 
 		 313 aa  646    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0603  hypothetical protein  33.97 
 
 		 388 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3658  phage integrase  29.24 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  23.81 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  31.16 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  26.64 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  26.05 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  23.58 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  23.58 
 
 		 337 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  24.41 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2866  integron integrase  30.61 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  30.97 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  22.97 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  25.15 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  28.24 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  21.6 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  23.86 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  24.64 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  23.64 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2195  integrase family protein  26.57 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 421 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  24 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.88 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  29.41 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  26.92 
 
 		 462 aa  42.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2395  integrase family protein  26.64 
 
 		 456 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.975926  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>