More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2490 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
353 aa  694    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.303146  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 
339 aa  392  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.640718  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
362 aa  311  7.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
339 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.76239  normal  0.869294 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
306 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  32.29 
 
 
318 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4455  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  33.24 
 
 
313 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000539356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
318 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  31.2 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
334 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
313 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
305 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.507532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
341 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
317 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
341 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.714161  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
318 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
311 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.82352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
321 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  30.97 
 
 
326 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
313 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2266  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.88 
 
 
305 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0437136  normal  0.510815 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
313 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2575  peptide ABC transporter, permease protein  31.59 
 
 
305 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
333 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
308 aa  158  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
313 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
316 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.75 
 
 
306 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022065  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
311 aa  157  4e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
306 aa  156  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1029  dipeptide ABC transporter, permease protein  31.78 
 
 
357 aa  155  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.234633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
311 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
332 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19550  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  33.14 
 
 
336 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
335 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1252  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.62 
 
 
356 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.63 
 
 
333 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391976  normal  0.26803 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
332 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11391  putative ABC transporter, oligopeptides  33.23 
 
 
354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
324 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.75 
 
 
313 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000799384  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
322 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.031511  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.79 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1510  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.18 
 
 
341 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000209407  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
333 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3132  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.88 
 
 
340 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3654  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.32 
 
 
304 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  29.13 
 
 
339 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
340 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
308 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
313 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0196  peptide/opine/nickel ABC transporter inner membrane protein  32.18 
 
 
356 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0448682 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
356 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
356 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0210654  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
335 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.181035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
321 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.14 
 
 
325 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.15877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  31.79 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2561  ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8180  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  29.89 
 
 
313 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.119694  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.076951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642947  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00157663  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0719  hypothetical protein  30.23 
 
 
316 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.870853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
318 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
319 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 
305 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
352 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
324 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
318 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1275  ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.572487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1918  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.43 
 
 
333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  28.9 
 
 
336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
333 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
335 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299286  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1049  ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
356 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1310  ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
356 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1391  ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
356 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0350688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
316 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0248  ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
356 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
327 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0519  ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
356 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4119  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  28.49 
 
 
341 aa  146  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1443  ABC transporter, permease protein  32.55 
 
 
330 aa  146  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.09 
 
 
345 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.716973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  28.61 
 
 
339 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>