More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1086 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2994  acetyl-CoA acetyltransferase  93.91 
 
 		 427 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.975276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1086  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 427 aa  875    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1523  acetyl-CoA acetyltransferase  70.35 
 
 		 462 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0827  acetyl-CoA acetyltransferase  58.63 
 
 		 434 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0689  acetyl-CoA acetyltransferase  56.24 
 
 		 431 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1488  acetyl-CoA acetyltransferase  56 
 
 		 431 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0806  acetyl-CoA acetyltransferase  53.65 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  53.99 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1555  acetyl-CoA acetyltransferase  53.41 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1428  acetyl-CoA acetyltransferase  53.41 
 
 		 439 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3557  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 438 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2605  acetyl-CoA acetyltransferases  38.14 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299811  normal  0.76477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2454  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.91 
 
 		 436 aa  252  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.363311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  37.3 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  37.15 
 
 		 392 aa  244  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  35.45 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  35.23 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000519  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.96 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.73 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  34.85 
 
 		 395 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  34.32 
 
 		 401 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.72 
 
 		 435 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  37.73 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0515  acetyl-CoA acetyltransferase  34.74 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.53 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  37.79 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  37.18 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  35.81 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  34.25 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05366  acetyl-CoA acetyltransferase  35.27 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.41 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  33.49 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.6 
 
 		 403 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.34 
 
 		 401 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  34.27 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  37.41 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.03 
 
 		 435 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.12 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.39 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  33.79 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.11 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2626  acetyl-CoA acetyltransferase  35.49 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  33.72 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  36.02 
 
 		 393 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.24 
 
 		 401 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  35.08 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.24 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1611  acetyl-CoA acetyltransferase  33.49 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.826768  normal  0.0195294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.24 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  33.64 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  36.05 
 
 		 399 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0630  acetyl-CoA acetyltransferase  34.66 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.81 
 
 		 435 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  33.56 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.9 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  32.57 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  34.92 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  36.02 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.96 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  35.92 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  34.34 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  32.79 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.27 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  33.86 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  32.86 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.45 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  33.49 
 
 		 425 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.59 
 
 		 391 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  220  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  37.04 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  37.04 
 
 		 387 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  37.04 
 
 		 387 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0414  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 		 439 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602422  hitchhiker  0.00366444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.88 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.05 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  32.79 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.04 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0109  acetyl-CoA acetyltransferases subfamily protein  34.19 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.81 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11720  acetyl-CoA acetyltransferase  34.51 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000631784  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0429  acetyl-CoA acetyltransferase  32.49 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.621378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1917  acetyl-CoA acetyltransferase  33.95 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.566593  hitchhiker  0.00000376482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.87 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2847  acetyl-CoA acetyltransferase  33.95 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  33.18 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  33.18 
 
 		 394 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0195  acetyl-CoA acetyltransferase  33.02 
 
 		 426 aa  216  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.11 
 
 		 387 aa  216  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0656  acetyl-CoA acetyltransferase  34.03 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.33 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  35.75 
 
 		 391 aa  216  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1310  acetyl-CoA acetyltransferase  31.16 
 
 		 526 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>