More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1673 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0429  acetyl-CoA acetyltransferase  78.19 
 
 
439 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.621378  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1703  acetyl-CoA acetyltransferase  89.35 
 
 
442 aa  794    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  75.18 
 
 
425 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135487  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  96.54 
 
 
433 aa  854    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1257  acetyl-CoA acetyltransferase  72.43 
 
 
428 aa  637    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.62872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
433 aa  882    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0414  acetyl-CoA acetyltransferase  77.96 
 
 
439 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602422  hitchhiker  0.00366444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63250  acetyl-CoA acetyltransferase  73.77 
 
 
425 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5507  acetyl-CoA acetyltransferase  73.54 
 
 
425 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0645  acetyl-CoA acetyltransferase  73.27 
 
 
425 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4582  acetyl-CoA acetyltransferase  73.6 
 
 
425 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0262438 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  72.07 
 
 
438 aa  625  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0656  acetyl-CoA acetyltransferase  72.37 
 
 
425 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  72.9 
 
 
425 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  72.66 
 
 
425 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0744  thiolase family protein  73.04 
 
 
425 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0627  acetyl-CoA acetyltransferase  72.77 
 
 
425 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0148  acetyl-CoA acetyltransferase  67.75 
 
 
430 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000426829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  67.75 
 
 
430 aa  588  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  68.84 
 
 
428 aa  584  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0195  acetyl-CoA acetyltransferase  69.81 
 
 
426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2847  acetyl-CoA acetyltransferase  68.85 
 
 
426 aa  578  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38960  acetyl-CoA acetyltransferase  67.75 
 
 
442 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59796  normal  0.17992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1390  acetyl-CoA acetyltransferase  65.58 
 
 
608 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000140507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2144  acetyl-CoA acetyltransferase  66.43 
 
 
456 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404851  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1310  acetyl-CoA acetyltransferase  64.5 
 
 
526 aa  553  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1068  acetyl-CoA acetyltransferase  64.5 
 
 
537 aa  554  1e-156  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20563  normal  0.644647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  62.73 
 
 
443 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  63.93 
 
 
434 aa  536  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0111069  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1891  acetyl-CoA acetyltransferase  64.57 
 
 
453 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000305655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0428  acetyl-CoA acetyltransferase  63.47 
 
 
427 aa  531  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3321  acetyl-CoA acetyltransferase  59.86 
 
 
426 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0411  acetyl-CoA acetyltransferase  63.47 
 
 
433 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0668027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21250  acetyl-CoA acetyltransferase  64 
 
 
436 aa  525  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287757  normal  0.606755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11720  acetyl-CoA acetyltransferase  62.85 
 
 
447 aa  523  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000631784  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34950  3-ketoacyl-CoA thiolase  62.33 
 
 
470 aa  524  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.579675  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2378  acetyl-CoA acetyltransferase  61.47 
 
 
438 aa  521  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0593786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6972  acetyl-CoA acetyltransferase  65.88 
 
 
421 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4453  acetyl-CoA acetyltransferase  62.21 
 
 
431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0231  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 
433 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.203475  normal  0.315006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0241  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 
433 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0251  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 
433 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0260  acetyl-CoA acetyltransferase  63.23 
 
 
446 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.190173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0128  acetyl-CoA acetyltransferase  60.79 
 
 
431 aa  506  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3585  acetyl-CoA acetyltransferase  60.6 
 
 
448 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2937  acetyl-CoA acetyltransferase  60.59 
 
 
453 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.715943  normal  0.439632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10246  acetyl-CoA acetyltransferase  62 
 
 
440 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23480  acetyl-CoA acetyltransferase  58.92 
 
 
440 aa  478  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.482258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04228  acetyl-CoA acetyltransferase  59.5 
 
 
395 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381913  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4028  acetyl-CoA acetyltransferase  60.77 
 
 
398 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0742444  normal  0.074414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.64 
 
 
435 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.41 
 
 
435 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.18 
 
 
435 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.95 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2781  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.49 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1597  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.26 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182557  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2856  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.26 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2761  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.26 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.780943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1399  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.36 
 
 
436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.4  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1508  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.36 
 
 
436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0149559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0383  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.12 
 
 
436 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  44.47 
 
 
433 aa  300  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0593596  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2460  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.56 
 
 
436 aa  298  9e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.207834  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2822  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.61 
 
 
437 aa  297  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1443  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.61 
 
 
437 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0564  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.68 
 
 
484 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02701  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.69 
 
 
436 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1628  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.25 
 
 
436 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00862019 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2426  3-ketoacyl-CoA thiolase  41 
 
 
436 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2110  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.17 
 
 
438 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3379  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.32 
 
 
436 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3027  3-ketoacyl-CoA thiolase  41 
 
 
436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2599  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.98 
 
 
436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1407  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.5 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.14601  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1472  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.5 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367131  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1460  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.5 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.395915  hitchhiker  0.0000132938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2677  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.9 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2578  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.89 
 
 
436 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.806259  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2618  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.89 
 
 
436 aa  282  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.101246  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2501  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.39 
 
 
436 aa  282  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2882  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.13 
 
 
436 aa  281  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.348178  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1663  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 
436 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0806954  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2529  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.64 
 
 
436 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2743  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.64 
 
 
436 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3485  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.39 
 
 
436 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2638  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.9 
 
 
436 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03121  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.81 
 
 
435 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02266  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 
436 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1315  acetyl-CoA C-acyltransferase FadI  39.9 
 
 
436 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3089  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.25 
 
 
436 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02227  hypothetical protein  39.9 
 
 
436 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.977163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2722  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.9 
 
 
436 aa  280  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1340  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.22 
 
 
439 aa  280  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1311  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.66 
 
 
436 aa  279  7e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.995653  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1529  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.9 
 
 
436 aa  279  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.962111  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2631  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.64 
 
 
436 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  hitchhiker  0.00000000000887163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2493  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.9 
 
 
436 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2168  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.9 
 
 
436 aa  275  8e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3157  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.85 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2598  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.64 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>