More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0052 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  799    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0529  Acetyl-CoA acetyltransferase  54.2 
 
 
384 aa  426  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000519  3-ketoacyl-CoA thiolase  52.37 
 
 
403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
395 aa  403  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3239  acetyl-CoA acetyltransferase  52.59 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.127109 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.53 
 
 
393 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05366  acetyl-CoA acetyltransferase  52.62 
 
 
403 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
392 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
394 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
392 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
393 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
392 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
393 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
393 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
394 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
392 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
393 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
393 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
393 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3533  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
403 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3171  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3299  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
392 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
392 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
392 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
395 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0363  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
394 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0630  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 
401 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
394 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
394 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
394 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
394 aa  375  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 
401 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
395 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  52.67 
 
 
394 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
394 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
390 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
392 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
393 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
393 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
394 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
401 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 
393 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
393 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 
392 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
393 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2213  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
392 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000256776  normal  0.0132753 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0515  acetyl-CoA acetyltransferase  48.26 
 
 
403 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
394 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
393 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02692  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
393 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0846  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.874703  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  368  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0871  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
393 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
392 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4113  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000455591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2992  acetyl-CoA acetyltransferase  48.59 
 
 
393 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.936911  normal  0.139342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02655  hypothetical protein  48.59 
 
 
393 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.990226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3016  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2991  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00959201  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
391 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.26 
 
 
391 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3166  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.989786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
398 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
393 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
393 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
390 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
393 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.533639  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 
393 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  50.38 
 
 
390 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5142  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 
393 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 
394 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 
392 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0522  acetyl-CoA acetyltransferase  50.78 
 
 
395 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.061167  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
392 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
394 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.35 
 
 
396 aa  363  3e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>