More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0630 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0630  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
401 aa  803    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000519  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.32 
 
 
403 aa  595  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05366  acetyl-CoA acetyltransferase  71.57 
 
 
403 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0515  acetyl-CoA acetyltransferase  59.35 
 
 
403 aa  503  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3533  acetyl-CoA acetyltransferase  58.9 
 
 
403 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2626  acetyl-CoA acetyltransferase  57.89 
 
 
402 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1134  acetyl-CoA acetyltransferase  54.27 
 
 
398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  54.02 
 
 
400 aa  448  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  53.5 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  53.25 
 
 
392 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  53 
 
 
393 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  54.75 
 
 
393 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  53.37 
 
 
393 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  52.75 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  53.48 
 
 
395 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  53.25 
 
 
393 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  52 
 
 
392 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  51.51 
 
 
394 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  53 
 
 
393 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  52.5 
 
 
393 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  53.87 
 
 
393 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 
395 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  52.5 
 
 
393 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  52.99 
 
 
393 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  52.5 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  52.5 
 
 
393 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  53.25 
 
 
393 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 
393 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 
393 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  51.26 
 
 
394 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
394 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  53.25 
 
 
393 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 
392 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  52.49 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  52.5 
 
 
393 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  52.5 
 
 
393 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  52.49 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  52.49 
 
 
393 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  51.25 
 
 
392 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
394 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  52 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  52 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  51.76 
 
 
392 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  51.75 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  51.75 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  52 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 
393 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 
398 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
392 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
390 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
392 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  52 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  51.63 
 
 
393 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  51.38 
 
 
395 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  50.5 
 
 
394 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
394 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
394 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  49.5 
 
 
392 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
394 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 
394 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 
393 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 
394 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
393 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
392 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  51.88 
 
 
390 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  50.88 
 
 
392 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 
393 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  52.37 
 
 
394 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 
394 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
393 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  52.37 
 
 
394 aa  381  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  53.48 
 
 
393 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 
393 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  51.38 
 
 
393 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 
393 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  379  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  50.12 
 
 
392 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  51.87 
 
 
394 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 
393 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3171  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
392 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  49.12 
 
 
392 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
392 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  51 
 
 
392 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
408 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.76 
 
 
396 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.27 
 
 
396 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
392 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  52.88 
 
 
392 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  50.75 
 
 
392 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
394 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  50.88 
 
 
391 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
390 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.25 
 
 
390 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  52 
 
 
393 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
392 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
391 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>