More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3171 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  97.45 
 
 
392 aa  782    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3171  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  796    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  64.52 
 
 
394 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  64.01 
 
 
394 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  64.01 
 
 
394 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  64.01 
 
 
394 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  64.01 
 
 
394 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  64.01 
 
 
394 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 
394 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  59.54 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 
393 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  59.54 
 
 
392 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  59.29 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  59.29 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 
392 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  60.56 
 
 
393 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  59.08 
 
 
392 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  58.82 
 
 
392 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  60.31 
 
 
393 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 
392 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 
395 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  57.14 
 
 
393 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  55.36 
 
 
392 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  59.23 
 
 
392 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  57.84 
 
 
392 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  56.46 
 
 
393 aa  434  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
391 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 
392 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  56.12 
 
 
392 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  57.36 
 
 
394 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  56.12 
 
 
392 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
392 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  57.33 
 
 
394 aa  431  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  56.49 
 
 
392 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  58.02 
 
 
393 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  57.76 
 
 
393 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
394 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  55.36 
 
 
392 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  56.46 
 
 
393 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
394 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
394 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 
393 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  58.78 
 
 
393 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  57.4 
 
 
390 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  56.06 
 
 
393 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
393 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  58.23 
 
 
390 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  56.85 
 
 
394 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  56.06 
 
 
393 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  56.89 
 
 
393 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  56.06 
 
 
393 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 
393 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  56.2 
 
 
393 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 
393 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  55.98 
 
 
394 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  55.47 
 
 
392 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
393 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  55.84 
 
 
392 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 
393 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
393 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
393 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
390 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  57.14 
 
 
391 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  57.03 
 
 
390 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  57.11 
 
 
390 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.55 
 
 
393 aa  425  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  56.2 
 
 
393 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 
393 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 
393 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  55.61 
 
 
393 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
393 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
393 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
393 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  56.92 
 
 
398 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
393 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  58.31 
 
 
392 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  55.19 
 
 
393 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  56.2 
 
 
393 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  53.45 
 
 
392 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  55.87 
 
 
394 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  58.1 
 
 
392 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  57.07 
 
 
395 aa  418  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.52 
 
 
390 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  55.27 
 
 
392 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
393 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
393 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  54.22 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  55.93 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  55.84 
 
 
401 aa  411  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
391 aa  412  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
393 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  53.92 
 
 
393 aa  413  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  54.22 
 
 
392 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  53.67 
 
 
393 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
393 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  54.62 
 
 
393 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  56.05 
 
 
393 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  56.7 
 
 
393 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>