More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1380 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  82.82 
 
 		 390 aa  660    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  781    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  75.64 
 
 		 392 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  76.09 
 
 		 392 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  74.29 
 
 		 392 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  74.04 
 
 		 392 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  74.04 
 
 		 392 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  73.52 
 
 		 392 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  73.59 
 
 		 390 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  73.78 
 
 		 398 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  73.59 
 
 		 390 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  73.33 
 
 		 390 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  72.75 
 
 		 394 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  72.24 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  72.24 
 
 		 394 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  71.98 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  71.47 
 
 		 391 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1573  acetyl-CoA acetyltransferase  72.75 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  74.04 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  71.98 
 
 		 394 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  71.58 
 
 		 394 aa  566  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  70.95 
 
 		 392 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  74.04 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  70.98 
 
 		 408 aa  564  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  70.36 
 
 		 393 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  71.47 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  71.03 
 
 		 390 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  69.92 
 
 		 393 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  68.97 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  70.98 
 
 		 393 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  71.77 
 
 		 393 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1469  acetyl-CoA acetyltransferase  72.56 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  69.49 
 
 		 391 aa  549  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  68.97 
 
 		 390 aa  549  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  68.46 
 
 		 391 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  68.48 
 
 		 388 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  68.21 
 
 		 391 aa  543  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0632  acetyl-CoA acetyltransferase  70.77 
 
 		 390 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  67.18 
 
 		 391 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3735  acetyl-CoA acetyltransferase  67.44 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  68.12 
 
 		 391 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  65.38 
 
 		 390 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  63.27 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  63.52 
 
 		 392 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 		 392 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  63.27 
 
 		 392 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 392 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  61.99 
 
 		 392 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 		 392 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 392 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 		 393 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  61.89 
 
 		 395 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  62.15 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 392 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 392 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 		 393 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  61.54 
 
 		 394 aa  471  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  59.49 
 
 		 391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  61.38 
 
 		 393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  61.32 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  59.44 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  61.28 
 
 		 394 aa  464  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  61.73 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  62.76 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 392 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  61.07 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  57.84 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>