More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1883 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 
391 aa  775    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  58.21 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  57.95 
 
 
393 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  57.54 
 
 
392 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.97 
 
 
393 aa  444  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
392 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  56.67 
 
 
392 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
392 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
393 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
393 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
392 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  56.27 
 
 
393 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  56.27 
 
 
392 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
393 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  57.84 
 
 
395 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
393 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
392 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0032  acetyl-CoA acetyltransferase  56.15 
 
 
394 aa  428  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.713781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
393 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  54.22 
 
 
392 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0402  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
393 aa  424  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  54.1 
 
 
393 aa  425  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0412  acetyl-CoA acetyltransferase  55.9 
 
 
393 aa  424  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
393 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
393 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  56.44 
 
 
394 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  58.97 
 
 
395 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
392 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 
393 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 
393 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  57.03 
 
 
393 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 
393 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  54.22 
 
 
393 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 
392 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  55.38 
 
 
392 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  56.01 
 
 
393 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
393 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
393 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
393 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
393 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.31 
 
 
396 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
393 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 
391 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  56.01 
 
 
392 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  56.01 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  54.22 
 
 
393 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  55.01 
 
 
394 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  56.67 
 
 
401 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  54.22 
 
 
393 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0515  acetyl-CoA acetyltransferase  52.88 
 
 
403 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.3 
 
 
396 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
393 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
393 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  53.21 
 
 
391 aa  408  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
392 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  53.73 
 
 
394 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
392 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  54.96 
 
 
390 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
392 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  52.84 
 
 
408 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02151  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.39386  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  54.24 
 
 
394 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1426  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000528422 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02110  hypothetical protein  56.78 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  53.98 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  53.08 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2086  acetyl-CoA acetyltransferase  54.62 
 
 
392 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.849145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  53.2 
 
 
393 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2373  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
394 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
394 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3053  acetyl-CoA acetyltransferase  53.89 
 
 
391 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927009  normal  0.280487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  53.75 
 
 
391 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2365  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
394 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  53.61 
 
 
393 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 
394 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000519  3-ketoacyl-CoA thiolase  49 
 
 
403 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0632  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  54.24 
 
 
390 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  52.94 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1685  acetyl-CoA acetyltransferases  53.11 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  52.05 
 
 
391 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  52.7 
 
 
393 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>