More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2994 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2994  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
427 aa  872    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.975276  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1086  acetyl-CoA acetyltransferase  93.91 
 
 
427 aa  832    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1523  acetyl-CoA acetyltransferase  70.59 
 
 
462 aa  634    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0827  acetyl-CoA acetyltransferase  59.34 
 
 
434 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0689  acetyl-CoA acetyltransferase  56.94 
 
 
431 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1488  acetyl-CoA acetyltransferase  56.71 
 
 
431 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0806  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
450 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  54.93 
 
 
435 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1555  acetyl-CoA acetyltransferase  54.12 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1428  acetyl-CoA acetyltransferase  54.12 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3557  acetyl-CoA acetyltransferase  53.77 
 
 
438 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2605  acetyl-CoA acetyltransferases  38.6 
 
 
437 aa  306  3e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299811  normal  0.76477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2454  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.84 
 
 
436 aa  256  6e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.363311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  38.69 
 
 
411 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0052  acetyl-CoA acetyltransferase  37.15 
 
 
392 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000885488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  35.68 
 
 
398 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  35 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000519  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.88 
 
 
403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  35.94 
 
 
401 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  36.89 
 
 
403 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  35.2 
 
 
393 aa  237  3e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.77 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  35.03 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.41 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.96 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.17 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.17 
 
 
435 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  34.43 
 
 
392 aa  233  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0515  acetyl-CoA acetyltransferase  34.98 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  34.5 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2626  acetyl-CoA acetyltransferase  37.37 
 
 
402 aa  233  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  34.64 
 
 
396 aa  233  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  34.41 
 
 
433 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  34.85 
 
 
395 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  35.58 
 
 
398 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05366  acetyl-CoA acetyltransferase  36.19 
 
 
403 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  34.8 
 
 
425 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  38.03 
 
 
409 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  35.54 
 
 
394 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1441  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  37.5 
 
 
393 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0922147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.49 
 
 
401 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  36.95 
 
 
390 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  33.79 
 
 
404 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  36.81 
 
 
402 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  33.49 
 
 
435 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.26 
 
 
401 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0630  acetyl-CoA acetyltransferase  34.03 
 
 
401 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.95 
 
 
390 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  35.15 
 
 
394 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.05 
 
 
435 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  33.49 
 
 
433 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0627  acetyl-CoA acetyltransferase  35.12 
 
 
425 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  36.66 
 
 
412 aa  225  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  36.95 
 
 
390 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  33.64 
 
 
438 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  37.1 
 
 
405 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.88 
 
 
401 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  36.05 
 
 
399 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  34.11 
 
 
394 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  34.11 
 
 
394 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1883  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  35.98 
 
 
391 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.9 
 
 
399 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  34.43 
 
 
390 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.88 
 
 
401 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.88 
 
 
401 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  33.56 
 
 
399 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  35.88 
 
 
401 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  33.96 
 
 
391 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.65 
 
 
387 aa  223  7e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  37.12 
 
 
391 aa  222  9e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.65 
 
 
387 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.65 
 
 
387 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  36.34 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  34.57 
 
 
394 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1611  acetyl-CoA acetyltransferase  33.49 
 
 
397 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.826768  normal  0.0195294 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 
391 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  35.92 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  36.26 
 
 
373 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.65 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  34.91 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  34.23 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  34.35 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.65 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.65 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  32.71 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  32.48 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.88 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  33.41 
 
 
394 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.65 
 
 
387 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.65 
 
 
387 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>