More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0641 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0641  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 		 390 aa  762    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  68.72 
 
 		 390 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  67.61 
 
 		 398 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0274  acetyl-CoA acetyltransferase  67.69 
 
 		 390 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  66.84 
 
 		 394 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  67.18 
 
 		 394 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  66.92 
 
 		 394 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2996  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 		 390 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  66.58 
 
 		 394 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  66.58 
 
 		 394 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  66.58 
 
 		 394 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  66.67 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2256  acetyl-CoA acetyltransferase  64.36 
 
 		 390 aa  529  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5917  acetyl-CoA acetyltransferase  69.41 
 
 		 393 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7614  acetyl-CoA acetyltransferase  66.24 
 
 		 392 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4781  acetyl-CoA acetyltransferase  69.41 
 
 		 393 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  66.32 
 
 		 391 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3060  acetyl-CoA acetyltransferase  66.49 
 
 		 392 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0532  acetyl-CoA acetyltransferase  64.95 
 
 		 392 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  65.98 
 
 		 392 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4344  acetyl-CoA acetyltransferase  66.06 
 
 		 408 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0509  acetyl-CoA acetyltransferase  64.43 
 
 		 392 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2005  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  66.92 
 
 		 390 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.321555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  64.43 
 
 		 392 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  64.18 
 
 		 392 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2026  acetyl-CoA acetyltransferase  63.59 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  63.75 
 
 		 391 aa  504  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1380  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 391 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435446  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0832  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  65.9 
 
 		 390 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0844376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3822  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3117  acetyl-CoA acetyltransferase  64.08 
 
 		 393 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4150  acetyl-CoA acetyltransferase  64.77 
 
 		 393 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3066  acetyl-CoA acetyltransferase  61.03 
 
 		 391 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0493  acetyl-CoA acetyltransferase  62.31 
 
 		 391 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3374  acetyl-CoA acetyltransferase  62.72 
 
 		 393 aa  495  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2401  acetyl-CoA acetyltransferase  62.05 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1573  acetyl-CoA acetyltransferase  62.56 
 
 		 396 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.872481  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2466  acetyl-CoA acetyltransferase  61.03 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  62.02 
 
 		 388 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.775668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1469  acetyl-CoA acetyltransferase  64.87 
 
 		 391 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3735  acetyl-CoA acetyltransferase  61.79 
 
 		 391 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.902632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0632  acetyl-CoA acetyltransferase  63.33 
 
 		 390 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.697717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 393 aa  474  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 393 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  62.5 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 392 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 		 393 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 393 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 		 392 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 392 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1682  acetyl-CoA acetyltransferase  62.24 
 
 		 392 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.783536  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 393 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  59.44 
 
 		 393 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  61.54 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2023  acetyl-CoA acetyltransferase  58.16 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  57.4 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  58.61 
 
 		 393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 		 392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2804  acetyl-CoA acetyltransferase  56.63 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.914723  hitchhiker  0.0000152049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  58.31 
 
 		 393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  58.93 
 
 		 392 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2478  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0592  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01631  acetyl-CoA acetyltransferase  56.41 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  57.65 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2074  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 393 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>