More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2605 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2605  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 		 437 aa  891    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299811  normal  0.76477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.93 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.93 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.99 
 
 		 435 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2781  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.91 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2856  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.68 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2761  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.68 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.780943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1597  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.68 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182557  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0689  acetyl-CoA acetyltransferase  43.12 
 
 		 431 aa  356  5.999999999999999e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2460  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.45 
 
 		 436 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.207834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.22 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1488  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 		 431 aa  353  4e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3379  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.26 
 
 		 436 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02701  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.39 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2268  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.33 
 
 		 447 aa  349  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300826  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2168  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.6 
 
 		 436 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3027  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.6 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002856  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.33 
 
 		 435 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03121  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.33 
 
 		 435 aa  343  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2599  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.14 
 
 		 436 aa  342  7e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2426  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.16 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1545  acetyl-CoA acetyltransferase  40.89 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1628  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.68 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02266  acetyl-CoA acetyltransferase  44.29 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1315  acetyl-CoA C-acyltransferase FadI  44.29 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1443  3-ketoacyl-CoA thiolase  45 
 
 		 437 aa  339  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3485  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.06 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02227  hypothetical protein  44.29 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.977163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1508  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.25 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0149559  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1399  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.25 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.4  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2638  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.29 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1311  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.29 
 
 		 436 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.995653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2822  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.36 
 
 		 437 aa  339  7e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2722  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.06 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0383  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.25 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3157  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.17 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0564  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.09 
 
 		 484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1663  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.86 
 
 		 436 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0806954  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2677  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.22 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1407  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.45 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.14601  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1472  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.45 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367131  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1460  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.45 
 
 		 436 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.395915  hitchhiker  0.0000132938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2493  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.06 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0806  acetyl-CoA acetyltransferase  40.88 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2501  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.48 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3089  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.22 
 
 		 436 aa  332  6e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2882  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.15 
 
 		 436 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.348178  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1555  acetyl-CoA acetyltransferase  40.88 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1529  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.76 
 
 		 436 aa  330  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.962111  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2618  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.38 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.101246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  41.59 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0593596  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2743  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.38 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1428  acetyl-CoA acetyltransferase  40.88 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2529  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.38 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2578  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.89 
 
 		 436 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.806259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2631  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.38 
 
 		 436 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  hitchhiker  0.00000000000887163 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3557  acetyl-CoA acetyltransferase  41.33 
 
 		 438 aa  325  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2110  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.9 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0827  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1340  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.85 
 
 		 439 aa  309  5e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1523  acetyl-CoA acetyltransferase  38.92 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2994  acetyl-CoA acetyltransferase  38.6 
 
 		 427 aa  306  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.975276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1734  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.54 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.302868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1086  acetyl-CoA acetyltransferase  38.14 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2454  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.59 
 
 		 436 aa  295  9e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.363311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  39.24 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2598  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.59 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  38.97 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  40.23 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  39.3 
 
 		 392 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  38.75 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  38.75 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0781  acetyl-CoA acetyltransferase  39.86 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  39.53 
 
 		 395 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  39.07 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  40.61 
 
 		 393 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  39.2 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  40.61 
 
 		 393 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  40.61 
 
 		 393 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  40.61 
 
 		 393 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  40.38 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  40.38 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  39.3 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  38.28 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0249  acetyl-CoA acetyltransferase  38.12 
 
 		 392 aa  282  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28068  beta-ketoacyl-CoA thiolase  37.88 
 
 		 457 aa  281  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  38.64 
 
 		 394 aa  282  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1301  acetyl-CoA acetyltransferase  38.12 
 
 		 393 aa  282  1e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.135299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  39.72 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  40.38 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  40.14 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  39.91 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  40.28 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  40.38 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  40.56 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  40.38 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  38.88 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  40.14 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  40.85 
 
 		 393 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1668  acetyl-CoA acetyltransferase  40.65 
 
 		 401 aa  279  6e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>