More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1407 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02266  acetyl-CoA acetyltransferase  73 
 
 		 436 aa  642    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002856  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.06 
 
 		 435 aa  635    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1315  acetyl-CoA C-acyltransferase FadI  73 
 
 		 436 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2599  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.35 
 
 		 436 aa  821    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2882  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.64 
 
 		 436 aa  634    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.348178  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3485  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 		 436 aa  641    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3157  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.93 
 
 		 435 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3089  3-ketoacyl-CoA thiolase  98.39 
 
 		 436 aa  889    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2501  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.18 
 
 		 436 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3379  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.62 
 
 		 436 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2493  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.77 
 
 		 436 aa  637    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1311  3-ketoacyl-CoA thiolase  73 
 
 		 436 aa  641    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.995653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02701  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.08 
 
 		 436 aa  666    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3027  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.6 
 
 		 436 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0564  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.6 
 
 		 484 aa  653    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2460  3-ketoacyl-CoA thiolase  96.56 
 
 		 436 aa  875    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.207834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2761  3-ketoacyl-CoA thiolase  97.94 
 
 		 436 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.780943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02227  hypothetical protein  73 
 
 		 436 aa  642    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.977163  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1529  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.58 
 
 		 436 aa  818    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.962111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2638  3-ketoacyl-CoA thiolase  73 
 
 		 436 aa  642    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2856  3-ketoacyl-CoA thiolase  97.94 
 
 		 436 aa  882    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1663  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.46 
 
 		 436 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0806954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1628  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.28 
 
 		 436 aa  812    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862019 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2268  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.76 
 
 		 447 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300826  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1597  3-ketoacyl-CoA thiolase  97.94 
 
 		 436 aa  882    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182557  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1407  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 436 aa  898    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.14601  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1472  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 436 aa  898    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367131  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2677  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.58 
 
 		 436 aa  827    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1460  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 436 aa  898    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.395915  hitchhiker  0.0000132938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2781  3-ketoacyl-CoA thiolase  97.71 
 
 		 436 aa  882    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2168  3-ketoacyl-CoA thiolase  90.37 
 
 		 436 aa  808    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2426  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.58 
 
 		 436 aa  821    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2722  3-ketoacyl-CoA thiolase  73 
 
 		 436 aa  641    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2743  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.3 
 
 		 436 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2618  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 		 436 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.101246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1399  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.62 
 
 		 436 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.4  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2578  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.3 
 
 		 436 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.806259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0383  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.62 
 
 		 436 aa  628  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03121  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.36 
 
 		 435 aa  628  1e-179  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1508  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.62 
 
 		 436 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0149559  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2529  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.3 
 
 		 436 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2631  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 		 436 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  hitchhiker  0.00000000000887163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2822  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.89 
 
 		 437 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1443  3-ketoacyl-CoA thiolase  69.43 
 
 		 437 aa  600  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2598  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.35 
 
 		 437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1340  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.88 
 
 		 439 aa  554  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2110  3-ketoacyl-CoA thiolase  61.03 
 
 		 438 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  61.92 
 
 		 433 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0593596  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  52.58 
 
 		 435 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  52.35 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  52.11 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1734  3-ketoacyl-CoA thiolase  54.69 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.302868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.77 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2605  acetyl-CoA acetyltransferases  43.45 
 
 		 437 aa  354  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299811  normal  0.76477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2454  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.86 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.363311  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28068  beta-ketoacyl-CoA thiolase  37.26 
 
 		 457 aa  314  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3321  acetyl-CoA acetyltransferase  41.27 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0414  acetyl-CoA acetyltransferase  40.05 
 
 		 439 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602422  hitchhiker  0.00366444 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0429  acetyl-CoA acetyltransferase  40.05 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.621378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0128  acetyl-CoA acetyltransferase  40.71 
 
 		 431 aa  310  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1703  acetyl-CoA acetyltransferase  40.37 
 
 		 442 aa  302  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  40.47 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  40.47 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0656  acetyl-CoA acetyltransferase  40.24 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  40.56 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0627  acetyl-CoA acetyltransferase  40.24 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0195  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  40.23 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38960  acetyl-CoA acetyltransferase  39.15 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59796  normal  0.17992 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1390  acetyl-CoA acetyltransferase  38.91 
 
 		 608 aa  293  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000140507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4582  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 425 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0262438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1068  acetyl-CoA acetyltransferase  39.63 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20563  normal  0.644647 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1310  acetyl-CoA acetyltransferase  39.63 
 
 		 526 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63250  acetyl-CoA acetyltransferase  38.82 
 
 		 425 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0645  acetyl-CoA acetyltransferase  39.76 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  38.6 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1257  acetyl-CoA acetyltransferase  38.55 
 
 		 428 aa  286  5e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.62872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0148  acetyl-CoA acetyltransferase  38.37 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000426829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0744  thiolase family protein  39.53 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0428  acetyl-CoA acetyltransferase  38.34 
 
 		 427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5507  acetyl-CoA acetyltransferase  38.12 
 
 		 425 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  38.69 
 
 		 425 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04228  acetyl-CoA acetyltransferase  39.75 
 
 		 395 aa  279  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2847  acetyl-CoA acetyltransferase  38.69 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  37.97 
 
 		 434 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0111069  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4453  acetyl-CoA acetyltransferase  37.79 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  37.94 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3585  acetyl-CoA acetyltransferase  38.67 
 
 		 448 aa  265  8.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2144  acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 		 456 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404851  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  36.74 
 
 		 443 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2378  acetyl-CoA acetyltransferase  36.36 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0593786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1891  acetyl-CoA acetyltransferase  36.34 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000305655 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2937  acetyl-CoA acetyltransferase  36.84 
 
 		 453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.715943  normal  0.439632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0411  acetyl-CoA acetyltransferase  37.12 
 
 		 433 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0668027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23480  acetyl-CoA acetyltransferase  36.66 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.482258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0241  acetyl-CoA acetyltransferase  37.59 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0231  acetyl-CoA acetyltransferase  37.59 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.203475  normal  0.315006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0251  acetyl-CoA acetyltransferase  37.59 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11720  acetyl-CoA acetyltransferase  36.75 
 
 		 447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000631784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>