More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2426 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02266  acetyl-CoA acetyltransferase  71.56 
 
 		 436 aa  635    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0564  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.61 
 
 		 484 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.814496  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1315  acetyl-CoA C-acyltransferase FadI  71.56 
 
 		 436 aa  635    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3379  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.08 
 
 		 436 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2460  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.12 
 
 		 436 aa  845    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.207834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1597  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.35 
 
 		 436 aa  847    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182557  hitchhiker  0.0000400964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3157  3-ketoacyl-CoA thiolase  76.44 
 
 		 435 aa  663    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3089  3-ketoacyl-CoA thiolase  92.66 
 
 		 436 aa  812    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2599  3-ketoacyl-CoA thiolase  92.66 
 
 		 436 aa  812    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2761  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.35 
 
 		 436 aa  847    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.780943  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2856  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.35 
 
 		 436 aa  847    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.969791  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2426  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 		 436 aa  900    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0353439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02701  3-ketoacyl-CoA thiolase  74.77 
 
 		 436 aa  665    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02227  hypothetical protein  71.56 
 
 		 436 aa  635    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.977163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2781  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.12 
 
 		 436 aa  845    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1529  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.97 
 
 		 436 aa  807    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.962111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2638  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.56 
 
 		 436 aa  634    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1663  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.46 
 
 		 436 aa  653    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0806954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1407  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.58 
 
 		 436 aa  820    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.14601  hitchhiker  0.000294797 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1472  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.58 
 
 		 436 aa  820    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367131  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2677  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.51 
 
 		 436 aa  810    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2268  3-ketoacyl-CoA thiolase  73.15 
 
 		 447 aa  644    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300826  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1628  3-ketoacyl-CoA thiolase  92.89 
 
 		 436 aa  822    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862019 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1460  3-ketoacyl-CoA thiolase  93.58 
 
 		 436 aa  820    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.395915  hitchhiker  0.0000132938 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2168  3-ketoacyl-CoA thiolase  88.07 
 
 		 436 aa  781    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3027  3-ketoacyl-CoA thiolase  91.74 
 
 		 436 aa  812    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.193952  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3485  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.1 
 
 		 436 aa  634  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1311  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.56 
 
 		 436 aa  634  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.995653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2501  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.94 
 
 		 436 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2722  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.56 
 
 		 436 aa  634  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002856  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.53 
 
 		 435 aa  629  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2493  3-ketoacyl-CoA thiolase  71.33 
 
 		 436 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2529  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.3 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2618  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 		 436 aa  626  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.101246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1399  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.35 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.4  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2743  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.3 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.467701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2578  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.3 
 
 		 436 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.806259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1508  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.35 
 
 		 436 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0149559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2882  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.41 
 
 		 436 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.348178  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0383  3-ketoacyl-CoA thiolase  75.35 
 
 		 436 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2631  3-ketoacyl-CoA thiolase  72.54 
 
 		 436 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  hitchhiker  0.00000000000887163 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03121  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.6 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2822  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.8 
 
 		 437 aa  608  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1443  3-ketoacyl-CoA thiolase  70.34 
 
 		 437 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1340  3-ketoacyl-CoA thiolase  65.98 
 
 		 439 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2598  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.75 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2110  3-ketoacyl-CoA thiolase  60.56 
 
 		 438 aa  518  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  61.1 
 
 		 433 aa  511  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0593596  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0435  3-ketoacyl-CoA thiolase  52.35 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152468  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0436  3-ketoacyl-CoA thiolase  52.11 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0407  3-ketoacyl-CoA thiolase  51.88 
 
 		 435 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1734  3-ketoacyl-CoA thiolase  54.69 
 
 		 430 aa  448  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.302868  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4163  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.53 
 
 		 435 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2605  acetyl-CoA acetyltransferases  44.16 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.299811  normal  0.76477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2454  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.91 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.363311  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28068  beta-ketoacyl-CoA thiolase  38.03 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0128  acetyl-CoA acetyltransferase  41.88 
 
 		 431 aa  318  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0429  acetyl-CoA acetyltransferase  40.96 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.621378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0414  acetyl-CoA acetyltransferase  40.96 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.602422  hitchhiker  0.00366444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2016  acetyl-CoA acetyltransferase  39.86 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1703  acetyl-CoA acetyltransferase  41.3 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3321  acetyl-CoA acetyltransferase  40.57 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38960  acetyl-CoA acetyltransferase  40.33 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59796  normal  0.17992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1673  acetyl-CoA acetyltransferase  41.03 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2777  acetyl-CoA acetyltransferase  40.79 
 
 		 433 aa  298  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360136  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1310  acetyl-CoA acetyltransferase  39.77 
 
 		 526 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1390  acetyl-CoA acetyltransferase  39.63 
 
 		 608 aa  297  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000140507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0195  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 		 426 aa  297  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1068  acetyl-CoA acetyltransferase  39.53 
 
 		 537 aa  297  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.20563  normal  0.644647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0582  acetyl-CoA acetyltransferase  40.24 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.263613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0656  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0627  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0621  acetyl-CoA acetyltransferase  40.24 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0428  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 427 aa  295  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.42624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4582  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0262438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0645  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63250  acetyl-CoA acetyltransferase  39.06 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0744  thiolase family protein  40 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0148  acetyl-CoA acetyltransferase  37.95 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000426829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  38.18 
 
 		 430 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04228  acetyl-CoA acetyltransferase  40.5 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381913  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5507  acetyl-CoA acetyltransferase  38.59 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4453  acetyl-CoA acetyltransferase  38.69 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1257  acetyl-CoA acetyltransferase  39.06 
 
 		 428 aa  285  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.62872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0745  acetyl-CoA acetyltransferase  39.29 
 
 		 425 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  38.92 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0111069  normal  0.304528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2847  acetyl-CoA acetyltransferase  38.82 
 
 		 426 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0306  acetyl-CoA acetyltransferase  38.17 
 
 		 428 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2144  acetyl-CoA acetyltransferase  36.81 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404851  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0231  acetyl-CoA acetyltransferase  38.76 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.203475  normal  0.315006 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0411  acetyl-CoA acetyltransferase  37.84 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0668027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0241  acetyl-CoA acetyltransferase  38.76 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0251  acetyl-CoA acetyltransferase  38.76 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.152508 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2378  acetyl-CoA acetyltransferase  36.6 
 
 		 438 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0593786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3585  acetyl-CoA acetyltransferase  38.66 
 
 		 448 aa  266  7e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.654597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2937  acetyl-CoA acetyltransferase  37.76 
 
 		 453 aa  266  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.715943  normal  0.439632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3113  acetyl-CoA acetyltransferase  36.74 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1891  acetyl-CoA acetyltransferase  36.81 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000305655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23480  acetyl-CoA acetyltransferase  36.89 
 
 		 440 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.482258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10246  acetyl-CoA acetyltransferase  39.5 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>