More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3389 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3389  Adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
183 aa  335  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187473  hitchhiker  0.000182907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  58.9 
 
 
179 aa  160  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
174 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
176 aa  154  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  55.21 
 
 
174 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  55.21 
 
 
174 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  55.21 
 
 
174 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
170 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
192 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
175 aa  150  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1509  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
185 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0125965  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  57.76 
 
 
186 aa  147  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  56.96 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
172 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
172 aa  144  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
177 aa  144  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 
174 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
170 aa  143  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
193 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
172 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
187 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
172 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
172 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
183 aa  141  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
172 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
171 aa  140  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
170 aa  140  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
171 aa  140  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  45.68 
 
 
175 aa  140  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  45.21 
 
 
184 aa  140  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2307  Adenine phosphoribosyltransferase  52.72 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0679858  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  52.5 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
168 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
185 aa  138  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
179 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
180 aa  137  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 
174 aa  136  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
424 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
181 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
173 aa  136  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
179 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 
171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 
173 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1697  Adenine phosphoribosyltransferase  58.75 
 
 
163 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
199 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
170 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
180 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
181 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
181 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
179 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
181 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
171 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
181 aa  134  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
181 aa  134  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  42.31 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12604  adenine phosphoribosyltransferase  55.9 
 
 
223 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793855  normal  0.485658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
178 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  45 
 
 
185 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
181 aa  132  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
178 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
178 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
173 aa  132  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
172 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
176 aa  132  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>