More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0575 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0575  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 446 aa  858    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  51.39 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  46.54 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  49.54 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  52.07 
 
 		 447 aa  358  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  48.62 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  48.27 
 
 		 445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  43.45 
 
 		 499 aa  332  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  45.37 
 
 		 473 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  45.64 
 
 		 459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  45.7 
 
 		 479 aa  319  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  46.64 
 
 		 468 aa  319  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  46.14 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  48.28 
 
 		 444 aa  317  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  43.02 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  45.21 
 
 		 458 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  43.57 
 
 		 462 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  46.81 
 
 		 455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  43.36 
 
 		 467 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  42.66 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  43.74 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  39.91 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  47.55 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  42.86 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  43.45 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  41.31 
 
 		 474 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  45.25 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  41.84 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  44.12 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  41.24 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  45.93 
 
 		 472 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  39.96 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  38.94 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  42.89 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  40.87 
 
 		 470 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  42.89 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  41.07 
 
 		 458 aa  285  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  39.59 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  39.72 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  39.59 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  41.15 
 
 		 452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  41.38 
 
 		 457 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  41.11 
 
 		 457 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  40.05 
 
 		 456 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  39.63 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  41.74 
 
 		 476 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  38.34 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  40 
 
 		 478 aa  280  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  41.61 
 
 		 463 aa  279  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  41.19 
 
 		 440 aa  279  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  42.22 
 
 		 485 aa  279  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  44.2 
 
 		 478 aa  279  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  39.13 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  42.5 
 
 		 455 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  37.21 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  36.99 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  39.86 
 
 		 450 aa  274  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  39.91 
 
 		 453 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  43.85 
 
 		 474 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  42.6 
 
 		 482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  35.93 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  42.09 
 
 		 489 aa  273  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  40.77 
 
 		 494 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  42.25 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  41.23 
 
 		 487 aa  270  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  41.02 
 
 		 479 aa  270  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  35.68 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  39.26 
 
 		 452 aa  269  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  35.54 
 
 		 446 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  42.49 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  36.52 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  36.13 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  38.71 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  35.67 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  40.76 
 
 		 472 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  39.72 
 
 		 439 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  42.92 
 
 		 466 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  37.81 
 
 		 458 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  41.86 
 
 		 500 aa  263  4e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  38.24 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  41.18 
 
 		 460 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  36.97 
 
 		 438 aa  261  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  40.92 
 
 		 463 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0033  beta-galactosidase  45.45 
 
 		 420 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  42.16 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  40.6 
 
 		 517 aa  259  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  42.45 
 
 		 494 aa  259  6e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  41.09 
 
 		 435 aa  259  9e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  38.78 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  35.62 
 
 		 471 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  36.7 
 
 		 444 aa  256  7e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  38.06 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  40.7 
 
 		 488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  40.74 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  37.87 
 
 		 458 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  37.64 
 
 		 450 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  36.61 
 
 		 447 aa  253  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  41.28 
 
 		 471 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  41.43 
 
 		 463 aa  252  9.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  34.62 
 
 		 450 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>