77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0302 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  236  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  60.5 
 
 		 335 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  60.17 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  56.9 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  49.57 
 
 		 306 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  49.56 
 
 		 325 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  53.15 
 
 		 318 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  49.57 
 
 		 329 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  46.15 
 
 		 314 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  46.73 
 
 		 347 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  38.33 
 
 		 262 aa  70.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  38.46 
 
 		 310 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  41.67 
 
 		 351 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  43.4 
 
 		 339 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  39.42 
 
 		 320 aa  67  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  39.62 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  40.59 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  37.5 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  38.74 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  39.81 
 
 		 305 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  42.55 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  53.97 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  35.58 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  35.54 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  42.72 
 
 		 339 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  36.7 
 
 		 306 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  50 
 
 		 347 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  38.94 
 
 		 336 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  42.37 
 
 		 289 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  38.89 
 
 		 317 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  34.91 
 
 		 328 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  40.45 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  29.66 
 
 		 306 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  35.19 
 
 		 295 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  40.21 
 
 		 278 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  38.33 
 
 		 295 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  32.23 
 
 		 333 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  36.27 
 
 		 375 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  38.33 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  38.33 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  30.84 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  42.62 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  33.62 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  38.33 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  30.84 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  30.84 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  33.98 
 
 		 357 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  37.11 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  28.7 
 
 		 286 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  45.28 
 
 		 291 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  28.7 
 
 		 286 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  37.7 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  41.18 
 
 		 351 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  32.65 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  35.58 
 
 		 303 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0574  hypothetical protein  28.97 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0467384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  36.07 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  30.25 
 
 		 307 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  36.07 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  34.43 
 
 		 290 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  29.66 
 
 		 297 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  34.43 
 
 		 290 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  36.63 
 
 		 348 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  34.43 
 
 		 290 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  36.07 
 
 		 284 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  36.07 
 
 		 284 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  34.69 
 
 		 331 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  36.07 
 
 		 284 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  28.16 
 
 		 424 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  34.43 
 
 		 289 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  46 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  30.36 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  33.91 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  39.71 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  37 
 
 		 338 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  35.59 
 
 		 379 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  39.34 
 
 		 294 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>