38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4699 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  59.88 
 
 
348 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  34.38 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  26.97 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  28.62 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  31.89 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  35.42 
 
 
339 aa  56.2  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  33.12 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  34.48 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  34.48 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  34.48 
 
 
320 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  28.3 
 
 
306 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1533  hypothetical protein  27.88 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.837222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  27.51 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  30.68 
 
 
320 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  31.08 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  34.87 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  28.81 
 
 
325 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  28.96 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  30.28 
 
 
267 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  33.33 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  28.63 
 
 
327 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  47.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  31.03 
 
 
284 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  25.36 
 
 
314 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  31.21 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  31.21 
 
 
284 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  30.14 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  25.75 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  29.75 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  28.86 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  29.75 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.61 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  32 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  28.4 
 
 
321 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>