84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4502 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  653    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  49.68 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  38.51 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  36.51 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  40.98 
 
 
278 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  36.57 
 
 
335 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  35.85 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  36.18 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  34.17 
 
 
329 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  37.07 
 
 
267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  37.33 
 
 
262 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  32.43 
 
 
310 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  30.67 
 
 
374 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  32.2 
 
 
320 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  49.56 
 
 
120 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  32.33 
 
 
347 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  32.83 
 
 
306 aa  94  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  32.98 
 
 
331 aa  86.7  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  32.85 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  29.79 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.61 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  34.6 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  28.39 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  30.34 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  32.86 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  29.38 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  30.33 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  29.45 
 
 
336 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  27.3 
 
 
357 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  33.14 
 
 
291 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  32.21 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  30.87 
 
 
259 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  26.71 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  34.56 
 
 
295 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  28.95 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  36.69 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  37.8 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  31.37 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  39.6 
 
 
279 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  33.59 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  26.18 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  29.3 
 
 
299 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  34.38 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  33.72 
 
 
306 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  34.38 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  35.34 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  30.94 
 
 
281 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  30.94 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  30.94 
 
 
281 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  29.78 
 
 
296 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  29.01 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0574  hypothetical protein  33.93 
 
 
142 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0467384  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  36.28 
 
 
352 aa  51.2  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  29.09 
 
 
283 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  29.09 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  29.33 
 
 
330 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  37.76 
 
 
277 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  26.91 
 
 
284 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  26.91 
 
 
284 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  26.91 
 
 
284 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  26.79 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  25.83 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  37.76 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  26.47 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  37.76 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  26.47 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  30.33 
 
 
320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  30.33 
 
 
320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  30.33 
 
 
320 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  28 
 
 
201 aa  46.2  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  25.79 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  29.55 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  27.55 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  25.56 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  32.52 
 
 
319 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  26.71 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  32 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  34.65 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  34.65 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  34.65 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  32.48 
 
 
375 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  30.6 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  25.32 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>