31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0968 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  59.88 
 
 
338 aa  353  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  40.5 
 
 
339 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  27.49 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  29.72 
 
 
299 aa  63.2  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  30.92 
 
 
262 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  30.14 
 
 
347 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  30.65 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  24.19 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  26.22 
 
 
314 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  29.32 
 
 
306 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  25.43 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  29.52 
 
 
307 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  27.22 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  25.86 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  34.19 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  28.19 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  29.85 
 
 
284 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  29.85 
 
 
284 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  30.84 
 
 
352 aa  46.2  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  29.65 
 
 
284 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  26.72 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  31 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  29.12 
 
 
321 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  31.61 
 
 
259 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  26.67 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  26.67 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  31.03 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  30.08 
 
 
306 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  28.87 
 
 
327 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  31.55 
 
 
306 aa  42.7  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>