110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1050 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  49.36 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  37.86 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  37.54 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  34.38 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  36.77 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  41.41 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  38.04 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  36.61 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  38.5 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  49.57 
 
 		 120 aa  108  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  31.8 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  33.57 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  37.97 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  32.19 
 
 		 347 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  32.22 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  33.19 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  31.23 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  32.09 
 
 		 351 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  32.54 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  33.45 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  29.41 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  33.65 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  32.98 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  32.16 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  32.71 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  32.38 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  37.4 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  38.06 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30.08 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  35.1 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30.08 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  35.1 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30.08 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  37.29 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  31.72 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  34.44 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  36.43 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  33.79 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  34.39 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  36.5 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  36.96 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  29.9 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  36.24 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  30.45 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  28.06 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  36.13 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  28.06 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  36.13 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  36.13 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  35.66 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  28.29 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  32.45 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  37.06 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  36.02 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  34 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  33.12 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  35.51 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  34.88 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  32.82 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  32.82 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  32.58 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0574  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  57  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0467384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  39.29 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  36.2 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  32.58 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  32.58 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  31.82 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  27.71 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  29.32 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  35.34 
 
 		 289 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  40.68 
 
 		 301 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  35.75 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  35.09 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  31.82 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  32.35 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  25.38 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  30.04 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  27.94 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1953  hypothetical protein  29.17 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000104092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  35.88 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  32.97 
 
 		 348 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  30.64 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  37.4 
 
 		 293 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  44.93 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  44.93 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  28.04 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  31.78 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  32.09 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  34.48 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  26.9 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  37.72 
 
 		 351 aa  46.6  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  32 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>