129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4808 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  650    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  37.28 
 
 		 307 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  39.57 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  34.52 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  34.06 
 
 		 262 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  34.93 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  34.93 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  34.93 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  32.64 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  40.88 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  40.88 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  35.81 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  35.81 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  40.88 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  35.81 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  33.8 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.28 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.28 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  39.13 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  31.66 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  29.8 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  33.01 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  36.36 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  32.05 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  34.07 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  34.78 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  33.77 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  31.45 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  27.78 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  37.3 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  32.41 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  42.4 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  34.73 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  30.35 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  43.4 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  38.21 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  39.66 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  34.73 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  32.93 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  39.66 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  34.73 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  39.66 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  31.85 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  41.03 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  38.4 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  38.4 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  40.16 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  30.67 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  35.34 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  35.91 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  33.46 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  27.9 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  25.8 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  35.59 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  30.33 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  37.58 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  40 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  28.47 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  34.94 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  30.17 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  34.76 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  26.37 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  35.36 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  31.14 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  29.8 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  27.45 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  31.25 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  30.95 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  33.51 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  26.62 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  30.39 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  28.93 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  32.08 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  35.42 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  30.45 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  29.85 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  30.68 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  29.77 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5229  hypothetical protein  28.91 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  35.88 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  34.68 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  31.41 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  33.73 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  32.82 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  31.17 
 
 		 281 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  31.17 
 
 		 281 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  29.33 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  32.85 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  30.41 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  33.87 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  30.41 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  33.87 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  32.58 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  30.67 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  31.97 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  29.76 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  32.43 
 
 		 329 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  32.41 
 
 		 289 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>