94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4303 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  580  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  37.13 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  33.55 
 
 
335 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  34.26 
 
 
267 aa  105  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  27.55 
 
 
314 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  33.56 
 
 
305 aa  89.4  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  31.92 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  32.14 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  32.08 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  32.49 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  30.72 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  30.46 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  28.39 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  30.9 
 
 
321 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  29.08 
 
 
318 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  35.29 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  32.23 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  29.48 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  29.48 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  30.1 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  33.52 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  33.92 
 
 
357 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  30.73 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  30.73 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  35.11 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  29.07 
 
 
278 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.77 
 
 
278 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1506  hypothetical protein  34.33 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  34.59 
 
 
424 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  33.91 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  32.85 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  26.5 
 
 
329 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  27.24 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  28.97 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  27.59 
 
 
280 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  31.21 
 
 
293 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  30.96 
 
 
302 aa  56.2  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  31.91 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30.67 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  31.61 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  31.86 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  29.74 
 
 
291 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  33.85 
 
 
284 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  31.82 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  32.16 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  33.58 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  26.32 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  29.23 
 
 
331 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  33.5 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1053  protein of unknown function DUF559  34.57 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  32.1 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  31.41 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  28.44 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  27.35 
 
 
290 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  27.35 
 
 
290 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  27.35 
 
 
290 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  33.63 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  30.24 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  31.18 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  39.6 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  28.82 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  32.81 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3303  hypothetical protein  28 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  32.81 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  33.51 
 
 
295 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  31.58 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  26.01 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  29.06 
 
 
375 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  30.51 
 
 
317 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  34.88 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  30.56 
 
 
351 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  28.76 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  28.95 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  28.76 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  29.94 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  24.76 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0677  hypothetical protein  42.22 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04300  hypothetical protein  31.33 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169884  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  29.94 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3899  hypothetical protein  27.24 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  38.14 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  28.15 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1712  hypothetical protein  31.5 
 
 
237 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0110448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  30.41 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  30.41 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  30.28 
 
 
379 aa  43.5  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  30.41 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  32.61 
 
 
207 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31030  hypothetical protein  25.81 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  28 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  28 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>