104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1897 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  617  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  50.64 
 
 
299 aa  249  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  37.7 
 
 
321 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  38.48 
 
 
336 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  36.19 
 
 
306 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  38.15 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  39.44 
 
 
310 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  39.27 
 
 
307 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  37.95 
 
 
262 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  32.15 
 
 
320 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  35.5 
 
 
374 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  29.97 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  35.96 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  34.66 
 
 
275 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  38.5 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  50 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  40.14 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  40.14 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  40.14 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  27.78 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  34.52 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  34.52 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  38.92 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  30.15 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  35.48 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4159  hypothetical protein  39.27 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00219007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  39.69 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  36.14 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  31.41 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  35.11 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  35.11 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  35.11 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  35.11 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  35.11 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  31.43 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  36.31 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  28.72 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  31.9 
 
 
277 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  35.44 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  37.59 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  31.95 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  31.95 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  31.95 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  32.54 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  32.61 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  31.01 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  33.88 
 
 
288 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  30.32 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  32.39 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4733  hypothetical protein  32.42 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0630614  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  35.16 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  42.34 
 
 
261 aa  60.1  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  34.07 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  40.31 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  41.09 
 
 
284 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  32.99 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  39.06 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  30.48 
 
 
318 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  35.88 
 
 
303 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  32.16 
 
 
306 aa  55.8  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  33.09 
 
 
300 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  33.09 
 
 
300 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  33.09 
 
 
300 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  27 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  34.95 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  40.31 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  34.95 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  40.31 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  35.29 
 
 
281 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  32.56 
 
 
293 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  28.04 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  29.69 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  30.48 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  36.99 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3288  hypothetical protein  31.87 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  35.34 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0912  hypothetical protein  38.6 
 
 
289 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0938391  normal  0.0123481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  32.91 
 
 
303 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  30.18 
 
 
278 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  27.35 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  33.08 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  27.99 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  32.2 
 
 
304 aa  49.7  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  36.52 
 
 
294 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  34.46 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  32.62 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4443  hypothetical protein  31.69 
 
 
291 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4530  hypothetical protein  31.69 
 
 
291 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.679375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.37 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  32.64 
 
 
289 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  36.59 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4708  hypothetical protein  30.83 
 
 
301 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  33.92 
 
 
290 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  31.33 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  29.45 
 
 
325 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5764  hypothetical protein  29.61 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>