75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1976 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  33.13 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  36.36 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  36 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  32.63 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  35.49 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  31.1 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  30.77 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  35.69 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  27.84 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  32.39 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  28.67 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  27.47 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  33.48 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  32.5 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  30.52 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  34.78 
 
 		 259 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  32.06 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  30.56 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  31.52 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  45.79 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  37.42 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  26.97 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  31.01 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  29.17 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  30.88 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  34.76 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  32.03 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  31.54 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  31.54 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  28.77 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  31.54 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  31.94 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  30.95 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  29.2 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  31.47 
 
 		 289 aa  53.5  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  29.89 
 
 		 302 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  30.48 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  32.09 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  28.84 
 
 		 351 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  29.3 
 
 		 307 aa  53.1  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  28.88 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  32.45 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  29.96 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  30.97 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  34.62 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  35.06 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.844394  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  38.94 
 
 		 120 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  29.17 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  33.09 
 
 		 295 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0677  hypothetical protein  37.78 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  32.17 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  34.34 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2486  hypothetical protein  34.81 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  32.37 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2878  hypothetical protein  33.54 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  34.13 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  30.67 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  31.33 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  31.33 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11062  hypothetical protein  33.13 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  34.19 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0898  hypothetical protein  34.62 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  24.88 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  31.65 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  31.65 
 
 		 284 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  27.9 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  29.61 
 
 		 424 aa  43.1  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>