88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3967 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  46.06 
 
 		 318 aa  251  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  36.77 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  38.85 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  36.22 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  33.68 
 
 		 278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  36.27 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  34.07 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  37.24 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  33.64 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  33.01 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  50.43 
 
 		 120 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  30.92 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  28.34 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  36.04 
 
 		 351 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  32.48 
 
 		 314 aa  90.1  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  30.1 
 
 		 374 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  33.06 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.17 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  30.98 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  29.46 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  31.14 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  33.19 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  36.77 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  28.16 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  30.57 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  28.91 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  32.66 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  29.32 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.57 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.57 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  35.85 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  27.68 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  30.92 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  32.85 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  27.05 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  27.54 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  27.54 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  27.16 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  29.96 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  29.44 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  27.54 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  28.96 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  30.81 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  25.41 
 
 		 201 aa  53.1  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  31.33 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  29.21 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  29.21 
 
 		 281 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  31.33 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  31.17 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  30.63 
 
 		 289 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1692  hypothetical protein  31.33 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  30.49 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  31.96 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  31.96 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  30.49 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  31.96 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  31.4 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  34.75 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1742  hypothetical protein  27.71 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  30.67 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  27.89 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  29.92 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  32.35 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  28.41 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  29.88 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  29.17 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  29.81 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  32.41 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  32.41 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  32.41 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3163  hypothetical protein  31.43 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  26.53 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0574  hypothetical protein  29.75 
 
 		 142 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0467384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  37.21 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1953  hypothetical protein  26.62 
 
 		 379 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000104092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  32.67 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  32.67 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  32.67 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  25.73 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1460  hypothetical protein  25.86 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250595  normal  0.581069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  26.8 
 
 		 283 aa  43.1  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  26.67 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>