35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0217 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0574  hypothetical protein  47.14 
 
 
142 aa  127  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0467384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  32.98 
 
 
306 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  29.95 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  32.97 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  31.4 
 
 
335 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  30 
 
 
347 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  27.78 
 
 
320 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  32 
 
 
275 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  31.21 
 
 
310 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  30.47 
 
 
351 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  24.34 
 
 
318 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  34.03 
 
 
289 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  30 
 
 
319 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  25.41 
 
 
329 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  29.81 
 
 
328 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  28.93 
 
 
278 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  25.73 
 
 
314 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  27.56 
 
 
297 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  34.09 
 
 
295 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  33.91 
 
 
375 aa  45.8  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04430  hypothetical protein  30.15 
 
 
352 aa  45.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.311428  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  24.55 
 
 
306 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  28.12 
 
 
351 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  29.25 
 
 
327 aa  45.1  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  27.01 
 
 
307 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  29.45 
 
 
339 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  39.19 
 
 
261 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  25.47 
 
 
333 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  29.23 
 
 
320 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  29.23 
 
 
320 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  32.26 
 
 
293 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  29.23 
 
 
320 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  31.43 
 
 
301 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  32.84 
 
 
295 aa  42  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>