60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0865 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0865  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0633151  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2969  hypothetical protein  54.73 
 
 
333 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0527  hypothetical protein  51.66 
 
 
307 aa  242  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0459714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4023  hypothetical protein  50.5 
 
 
317 aa  230  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3121  hypothetical protein  47.18 
 
 
328 aa  195  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.829265  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1099  hypothetical protein  50.2 
 
 
306 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.994405  hitchhiker  0.000237406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0572  hypothetical protein  47.72 
 
 
351 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.959273  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2924  hypothetical protein  40.8 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1915  hypothetical protein  40.23 
 
 
297 aa  136  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  31.23 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  33.82 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  35.05 
 
 
293 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  30.32 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  30.32 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  30.32 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  33.19 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  33.01 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  34.39 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  44.95 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  30.91 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  30.91 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  33.8 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  33.8 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  33.33 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  29.9 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  30.47 
 
 
286 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  30.47 
 
 
286 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  31.75 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3007  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.153123  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2535  hypothetical protein  33.97 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  30.33 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  28.77 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  28.77 
 
 
277 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  29.39 
 
 
278 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  30.39 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  27.19 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  29.5 
 
 
294 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5265  hypothetical protein  28.67 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  30.8 
 
 
284 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  30.8 
 
 
284 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  28.31 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  30.8 
 
 
284 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0217  hypothetical protein  30 
 
 
201 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  28.82 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  35.83 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  27.91 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  27.91 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  27.91 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  27.97 
 
 
291 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  30.43 
 
 
289 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  29.34 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  30.43 
 
 
289 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  30.43 
 
 
289 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  28.06 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5477  hypothetical protein  29.02 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0193619  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  29.82 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0966  hypothetical protein  33.06 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  26.04 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  33.13 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  32.35 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>