51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4094 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  659    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0968  hypothetical protein  40.5 
 
 
348 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4699  hypothetical protein  34.38 
 
 
338 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  34.62 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  31.79 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  29.7 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  29.79 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  33.21 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  29.94 
 
 
374 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  29.24 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0286  hypothetical protein  31.21 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.141082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  31 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  29.43 
 
 
307 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  34.19 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  37.58 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  38.1 
 
 
295 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  27.12 
 
 
314 aa  62.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  30.04 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  32.52 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  24.23 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  30.23 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  31.5 
 
 
337 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  39.13 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  28.63 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2812  hypothetical protein  31.02 
 
 
261 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437661  normal  0.0518068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  25.61 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0302  hypothetical protein  42.72 
 
 
120 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  28.77 
 
 
294 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  30.81 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  29.03 
 
 
320 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  29.03 
 
 
320 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3817  hypothetical protein  35.9 
 
 
294 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal  0.529394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5457  hypothetical protein  30.03 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  28.63 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  26.86 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  29.21 
 
 
298 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  30.36 
 
 
320 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  28.22 
 
 
284 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  28.22 
 
 
284 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  27.11 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  32.39 
 
 
259 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  27.01 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  34.97 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22240  hypothetical protein  29.94 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.527189  normal  0.11385 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  29.53 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0927  hypothetical protein  31.22 
 
 
341 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  28.48 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>