More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0948 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0948  ribosomal protein S2  100 
 
 		 298 aa  617  1e-176  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.405377  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0532  30S ribosomal protein S2  56.2 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00675401  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9516  30S ribosomal protein S2  45.87 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0517  30S ribosomal protein S2  53.71 
 
 		 291 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.285229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1131  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 		 255 aa  268  7e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.439275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0514  30S ribosomal protein S2  52.84 
 
 		 288 aa  268  7e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1694  30S ribosomal protein S2  53.98 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.559566  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2029  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 		 256 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1162  30S ribosomal protein S2  52.68 
 
 		 256 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.278359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4517  30S ribosomal protein S2  53.15 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1119  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1586  30S ribosomal protein S2  53.3 
 
 		 262 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551794  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1381  30S ribosomal protein S2  51.79 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0583  30S ribosomal protein S2  53.12 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0651099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1776  30S ribosomal protein S2  52.94 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1583  30S ribosomal protein S2  52.17 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3450  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387566  normal  0.644555 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2223  30S ribosomal protein S2  53.85 
 
 		 361 aa  261  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3347  30S ribosomal protein S2  56 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.259933  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2436  30S ribosomal protein S2  52.7 
 
 		 334 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2073  30S ribosomal protein S2  52.94 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.193389  normal  0.160852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2347  30S ribosomal protein S2  52.94 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.473707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2528  30S ribosomal protein S2  52.27 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1698  30S ribosomal protein S2  52.49 
 
 		 349 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1859  30S ribosomal protein S2  51.35 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.113122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1694  30S ribosomal protein S2  51.35 
 
 		 332 aa  258  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4827  30S ribosomal protein S2  51.58 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.356192  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1380  30S ribosomal protein S2  52.02 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272546  normal  0.0375782 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  54.02 
 
 		 259 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2805  30S ribosomal protein S2  53.36 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00564496  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4439  30S ribosomal protein S2  52.02 
 
 		 334 aa  256  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000842833 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  52.21 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3268  30S ribosomal protein S2  54.05 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2828  30S ribosomal protein S2  53.15 
 
 		 331 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00696653  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2857  30S ribosomal protein S2  53.15 
 
 		 331 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  0.180299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1694  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  49.36 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2033  30S ribosomal protein S2  53.39 
 
 		 354 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3196  ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3726  30S ribosomal protein S2  48.93 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.361852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1530  SSU ribosomal protein S2P  53.6 
 
 		 249 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000131876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  51.82 
 
 		 235 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  48.5 
 
 		 253 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  50.43 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 251 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1210  30S ribosomal protein S2  52.89 
 
 		 256 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  51.58 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  49.59 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  50.43 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  48.18 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  51.11 
 
 		 257 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  48.47 
 
 		 238 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  52.25 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0882  ribosomal protein S2  53.3 
 
 		 236 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000183579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  51.1 
 
 		 267 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5313  ribosomal protein S2  47.66 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1249  ribosomal protein S2  47.6 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0295  30S ribosomal protein S2  49.01 
 
 		 315 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0657172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1553  ribosomal protein S2  46.15 
 
 		 242 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  50 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1160  ribosomal protein S2  48.65 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1444  ribosomal protein S2  48.65 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152019  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1679  30S ribosomal protein S2  50.88 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1673  30S ribosomal protein S2  50.88 
 
 		 254 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1006  30S ribosomal protein S2  47.58 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000128012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2981  30S ribosomal protein S2  47.52 
 
 		 241 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.44963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  50.9 
 
 		 256 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  49.59 
 
 		 244 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3281  30S ribosomal protein S2  50.66 
 
 		 242 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000428583  hitchhiker  0.0000650106 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1863  30S ribosomal protein S2  50.91 
 
 		 248 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  50.23 
 
 		 280 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1554  30S ribosomal protein S2  51.83 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  51.11 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3360  30S ribosomal protein S2  49.12 
 
 		 241 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.720807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0941  30S ribosomal protein S2  49.12 
 
 		 241 aa  238  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0031234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  51.8 
 
 		 343 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1250  30S ribosomal protein S2  51.33 
 
 		 251 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000302151  hitchhiker  0.0000384341 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1285  ribosomal protein S2  49.34 
 
 		 248 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3165  30S ribosomal protein S2  47.11 
 
 		 241 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2976  ribosomal protein S2  47.81 
 
 		 244 aa  238  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  49.55 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  51.12 
 
 		 232 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1348  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164287  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3161  30S ribosomal protein S2  50.9 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  normal  0.41061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1481  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000136329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1450  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000541736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1445  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000563194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2641  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811634  normal  0.237811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2708  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000765128  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  48.18 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2902  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000838626  normal  0.171153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2815  30S ribosomal protein S2  49.78 
 
 		 242 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0284  30S ribosomal protein S2  51.8 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.522399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>