38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1297 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  54.85 
 
 
253 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  48.13 
 
 
237 aa  229  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  50.84 
 
 
237 aa  203  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  46.64 
 
 
236 aa  198  7e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  44.35 
 
 
238 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  44.3 
 
 
244 aa  168  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  40.45 
 
 
243 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  36.86 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  49.79 
 
 
243 aa  150  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  34.75 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  33.9 
 
 
247 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  40.39 
 
 
247 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  32.64 
 
 
247 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  38.6 
 
 
255 aa  125  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  42.49 
 
 
255 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  39.73 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  38.34 
 
 
249 aa  112  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  37.56 
 
 
250 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  38.19 
 
 
244 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  37.25 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  44.33 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  32.31 
 
 
277 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  32.5 
 
 
247 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  36.57 
 
 
247 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  35.77 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  35.51 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  35.26 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  35.25 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0655  hypothetical protein  34.97 
 
 
313 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4324  hypothetical protein  37.16 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.344718  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0179  hypothetical protein  32.72 
 
 
305 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  30.61 
 
 
307 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1666  hypothetical protein  33.59 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26117  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1250  hypothetical protein  38.65 
 
 
287 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0854  hypothetical protein  35.19 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>