32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0732 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0732  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1280  hypothetical protein  40.61 
 
 
249 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0734  ApbE family lipoprotein  37.44 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0103  hypothetical protein  35.07 
 
 
247 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.442013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1439  hypothetical protein  33.92 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.598717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1430  ApbE family lipoprotein  37.97 
 
 
255 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000126798  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0550  hypothetical protein  38.1 
 
 
247 aa  111  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0919  hypothetical protein  36.75 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_790  hypothetical protein  36.6 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0909  hypothetical protein  38.54 
 
 
243 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0139116  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0803  hypothetical protein  36.32 
 
 
250 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2328  hypothetical protein  37.43 
 
 
246 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2124  hypothetical protein  33.06 
 
 
245 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0355  hypothetical protein  32.3 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.174238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3586  ApbE family lipoprotein  35.52 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1743  hypothetical protein  30.81 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.256952  normal  0.904611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0482  hypothetical protein  31.86 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396788  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1437  hypothetical protein  32.8 
 
 
247 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0044  hypothetical protein  32.78 
 
 
277 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0343  hypothetical protein  34.57 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0309  hypothetical protein  32.14 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3697  hypothetical protein  30.81 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.273762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0453  hypothetical protein  32.35 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2535  hypothetical protein  31.67 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1898  hypothetical protein  30.85 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0136  hypothetical protein  36.18 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1297  hypothetical protein  35.26 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0893074  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1274  hypothetical protein  31.79 
 
 
238 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.714961  normal  0.29978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1292  hypothetical protein  32.92 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0190888  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4067  hypothetical protein  29.63 
 
 
302 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00673359  normal  0.238063 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2147  hypothetical protein  28.87 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1519  hypothetical protein  39.29 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>